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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002385`

染色体: Chr05 坐标: 26299731-26303239 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002385`
名称	SmilChr05G002385
描述	30S ribosomal protein S1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26299731 - 26303239 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024277`
GeneID	`131024277`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024277`
原始查询	`SmilChr05G002385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S1, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein S1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G30510` (RPS1) ribosomal protein S1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833138] identity=77.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0315800` - identity=71.9; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00575 (S1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024277

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809774.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057809774.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809774.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809774.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26301151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:26301215`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr5:26301215`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr5:26303054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B2,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809774.1

410 aa

205

410

PF00575 S1 183-246 aa PF00575 S1 260-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809774.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	183	246	1.1e-32	112.9	S1 RNA binding domain
`XP_057809774.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	260	329	1.1e-32	112.9	S1 RNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953791.1
GTTGGATTTTGAGGCCCAAAATAGGAGCGGGCCCCACCCCACATCCTCCTCCCCTGGCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACCTTATCTCACCTCACCCAGCATTTCATAATCCAGAAATAACAATACACACAGTTGAGACTTCTCCTCACCTCGACCAATCAAATTTCCACAAAGATGGCATCTTTGGCGCAGCAAATCGGTGGGCTCAAGTGCCCGCCATTTTCAGCAGCCAAGAAGAACAAATTCTTGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024277
ATGGCATCTTTGGCGCAGCAAATCGGTGGGCTCAAGTGCCCGCCATTTTCAGCAGCCAAGAAGAACAAATTCTTGTCCAACTCCAAGACGGTGCTGCCTAGAAGGAGAAGCGTCATTACAGCAGCTGCAGTCATTGCTAACGCACAGACACGAGAGAGAATGAAGTTGAAGGAGATGTTCGAGGACGCCTACGAGCGCTGCCGTACTACGCCCATGGAAGGCGTCTCCTTCACCGTCGAAGACTTCAATGATGCTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809774.1
MASLAQQIGGLKCPPFSAAKKNKFLSNSKTVLPRRRSVITAAAVIANAQTRERMKLKEMFEDAYERCRTTPMEGVSFTVEDFNDALEKYDFTSEIGAKVKGKVYNTDSNGALVDITAKSSAYLPLREAAIYNIKHVEEAGIVAGVVEEFVIIGENEADDSLILSLRSIQYDLAWERCRQLQAEDVVVKGKIVGANKGGIVALVEGLRGFVPFSQISTKSTAEDLLEKELPLKFVEVDEEQSRLVLSNRKAMADSQAQLGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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