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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002389`

染色体: Chr05 坐标: 26384489-26385521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002389`
名称	SmilChr05G002389
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26384489 - 26385521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025721`
GeneID	`131025721`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025721`
原始查询	`SmilChr05G002389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30; qcov=1.07; evalue=3.95e-38; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=28.3; qcov=1.06; evalue=6.72e-33; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811496.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811496.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811496.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811496.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26384496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B125,B45,C12,C19
`Chr5:26384518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D1
`Chr5:26384547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B52,B9,C14,C29
`Chr5:26384563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A3,B113,B125,B25,B26,B27,B36,B45,B69,C12,C19,C32,C37,C68,D5,D8
`Chr5:26384579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C59
`Chr5:26384612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C59
`Chr5:26384847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A3,B103,B113,B115,B122,B125,B22,B25,B26,B27,B36,B45,B69,C12,C19,C32,C37,C68,D5,D8
`Chr5:26384868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B102,C42
`Chr5:26384905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:26385060`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B103,B113,B115,B122,B125,B22,B26,B27,B45,C12,C19,C32,C37,C68,D5,D8
`Chr5:26385291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B31,C67,D10
`Chr5:26385330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B31,C67

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955513.1
ATGGATGAGTCACATCAGTTGATTATGCTGAAGTGTGCCAAGGCCAATATTGGACTAGTGAGGGCATTTCGTATTTTTAAAGAACTGGTTGGAAGTTTTGAGGAAGTGGGGTGCACCAGCAAGGACTTTAAAAATCTATCGTACACCATGAATTCATACGCGGATGGTGTTGATGCACAACTACTACTTGACAGGTTTCTAAGTAAACGTGAAACTAATGAATGTTTCAAGTGTGAATATTTAGTTGATGAAACTCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025721
ATGGATGAGTCACATCAGTTGATTATGCTGAAGTGTGCCAAGGCCAATATTGGACTAGTGAGGGCATTTCGTATTTTTAAAGAACTGGTTGGAAGTTTTGAGGAAGTGGGGTGCACCAGCAAGGACTTTAAAAATCTATCGTACACCATGAATTCATACGCGGATGGTGTTGATGCACAACTACTACTTGACAGGTTTCTAAGTAAACGTGAAACTAATGAATGTTTCAAGTGTGAATATTTAGTTGATGAAACTCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811496.1
MDESHQLIMLKCAKANIGLVRAFRIFKELVGSFEEVGCTSKDFKNLSYTMNSYADGVDAQLLLDRFLSKRETNECFKCEYLVDETHKVKSLFWSDVVAVQNYSLFGDVVFFDATYTTNRYDMIFLHLPARIIMVGVLHLEQDQDPALKITVENVMPNTRHRFCMWHIMMKLAQKLSNSLREDAELKSEIHSVVWSELDEPADFERKWTEVLDQYELTDNTWLANMFSLRSYWIPAYFRDLSMSGLFRTTSLSESENSFFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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