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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002411`

染色体: Chr05 坐标: 26620663-26622284 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002411`
名称	SmilChr05G002411
描述	MATH domain and coiled-coil domain-containing protein At2g42460
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26620663 - 26622284 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024705`
GeneID	`131024705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024705`
原始查询	`SmilChr05G002411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MATH domain and coiled-coil domain-containing protein At2g42460
产物	MATH domain and coiled-coil domain-containing protein At2g42460
Arabidopsis	`AT3G17380` (AT3G17380) TRAF-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821002] identity=50.8; qcov=0.965; evalue=8.3e-116; confidence=high
Rice	`Os10g0478450` (Os2M1) - identity=32; qcov=0.637; evalue=1.61e-22; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00917 (MATH); PF22486 (MATH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810226.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810226.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810226.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810226.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810226.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26621104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D3
`Chr5:26621701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810226.1

314 aa

157

314

MATH_2

MATH

MATH_2

MATH

PF22486 MATH_2 23-156 aa PF00917 MATH 38-157 aa PF22486 MATH_2 180-305 aa PF00917 MATH 189-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810226.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	23	156	3e-69	232.3	MATH domain
`XP_057810226.1`	Pfam	`PF00917`	MATH	Domain	38	157	1.2e-24	87.4	MATH domain
`XP_057810226.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	180	305	3e-69	232.3	MATH domain
`XP_057810226.1`	Pfam	`PF00917`	MATH	Domain	189	307	1.2e-24	87.4	MATH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954243.1
TGGGACAACAAGAGAAGACCCAAATCAAGCAAAGGATAGCTTTTCTACCACCTTTTGTTTCTCATCATATCCTTAAGAACCTCATCAACCTCACCAACATCTCTCTGTCTTTCTCTCTCTCACCAACATCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTTGATCTTCACCTGATGGGAGAATTATCATTCCCTGGACAAGAAGGGGTCACGAGATCAATTTCAGATACACCTCCAACTCACTACATATTCAAACTTCAACTATTCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024705
ATGGGAGAATTATCATTCCCTGGACAAGAAGGGGTCACGAGATCAATTTCAGATACACCTCCAACTCACTACATATTCAAACTTCAACTATTCTCACAACTTGTTAACAAGAAGCTAGAGAGCTACACCTCCAATGAATTCCAAGCTGGCGGCTGCATATGGAAACTGGTTCTTCACCCTAATGGTAACAAAAACAAAGGCATTAGCGACCACATCTCCCTATACTTGGTCATTGTCGAGCCAAACTCACACGGCCCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810226.1
MGELSFPGQEGVTRSISDTPPTHYIFKLQLFSQLVNKKLESYTSNEFQAGGCIWKLVLHPNGNKNKGISDHISLYLVIVEPNSHGPAWEIRALFRLFLLDQNNDSYLTLQDTAENGRRFHRMKLAWGFDKFIPLDAFKDAVNGYLVDDTCVFGAEVYVCQEKIAGKGECLSMIKDAIAYTHTWRVDLSSSLTEECVYSKPFNAGDHKWKIQLYPNGKGSGIGSYVSLYLTLAEPANLPPASKIYAEFTLRILDQLNRKHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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