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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002425`

染色体: Chr05 坐标: 26735540-26736957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002425`
名称	SmilChr05G002425
描述	uncharacterized SmilChr05G002425
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26735540 - 26736957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025727`
GeneID	`131025727`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025727`
原始查询	`SmilChr05G002425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=35.3; qcov=0.563; evalue=2.32e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0357300` - identity=30.5; qcov=1.15; evalue=1.19e-38; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025727

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811501.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811501.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811501.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811501.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26735576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B79,D7
`Chr5:26735853`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B102,B108,B115,B121,B32,B37,B54,B68,B89,C26,C36,C87,D10
`Chr5:26735866`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A25,A5,B110,B12,B13,B140,B22,B99,C1,C11,C12,C22,C44,C45,C51,C65,C69,C76,C80,D11
`Chr5:26735950`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A19,A24,B105,B106,B11,B114,B119,B121,B126,B130,B131,B133,B20,B25,B29,B30,B31,B34,B44,B52,B55,B58,B63,B76,B80,B85,B9,B97,C29,C30,C33,C38,C49,C53,C54,C59,C70,C75,C78,C80,D2,D4,D8,D9
`Chr5:26735982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:26736027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C12
`Chr5:26736029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C83
`Chr5:26736062`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,B104,B105,B109,B11,B111,B117,B118,B119,B120,B123,B124,B126,B127,B131,B135,B138,B14,B15,B17,B19,B2,B20,B24,B25,B29,B3,B30,B33,B34,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B60,B62,B64,B66,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B85,B88,B90,B91,B92,B93,B96,B97,C10,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C22,C23,C25,C28,C29,C30,C32,C35,C36,C38,C4,C42,C43,C45,C46,C47,C49,C5,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D6,D8
`Chr5:26736395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B39,C6
`Chr5:26736397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B136,B39,C40
`Chr5:26736397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B39,C40
`Chr5:26736424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811501.1

302 aa

151

302

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 16-101 aa PF21530 Pif1_2B_dom 228-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811501.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	16	101	3e-33	116.0	PIF1-like helicase
`XP_057811501.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	228	274	7.8e-15	55.0	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955518.1
ATGAAGGATGTTGTCACCATCTTCAAGTCCTCGAAGCGGACCGTCACTCGCCTTTGGGCTGCAGCCAAGAAACAACAAAACAAAGCCTCGAGTGGTATAGCTTCATTATTACTCCCTAAAGGCAGAACTGCACACTCGAGATTTGGTATACCGTTAGATTGTGATGAGAACTCCACATGCCACAAGATCAAGCCAGACAGCAATTTCACTAGACTCCTCAAGAAGACAAAGCTCATTATTTGGGATGAAGCACCTATGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025727
ATGAAGGATGTTGTCACCATCTTCAAGTCCTCGAAGCGGACCGTCACTCGCCTTTGGGCTGCAGCCAAGAAACAACAAAACAAAGCCTCGAGTGGTATAGCTTCATTATTACTCCCTAAAGGCAGAACTGCACACTCGAGATTTGGTATACCGTTAGATTGTGATGAGAACTCCACATGCCACAAGATCAAGCCAGACAGCAATTTCACTAGACTCCTCAAGAAGACAAAGCTCATTATTTGGGATGAAGCACCTATGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811501.1
MKDVVTIFKSSKRTVTRLWAAAKKQQNKASSGIASLLLPKGRTAHSRFGIPLDCDENSTCHKIKPDSNFTRLLKKTKLIIWDEAPMTHKYCFEALDRSLKNGRTYGSDAEDIKKFAQLILSIRDGATGESIGDGEVDLRLPDDMIIRDSNNPISSIVKSTYPGVLHTVSDLEYFKDRAILAPTNNMVYSINEYVMSLMPAKERVYLSSDNICKDDGEVDLNDEVFSVEYLNTIKCLGLPSHEIKLKEGCIIILLINIDSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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