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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002431`

染色体: Chr05 坐标: 26812552-26813274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002431`
名称	SmilChr05G002431
描述	4-coumarate--CoA ligase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26812552 - 26813274 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025729`
GeneID	`131025729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025729`
原始查询	`SmilChr05G002431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-coumarate--CoA ligase 1-like
产物	4-coumarate--CoA ligase 1-like
Arabidopsis	`AT1G51680` (4CL1) 4-coumarate:CoA ligase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841593] identity=60.1; qcov=0.929; evalue=5.48e-91; confidence=high
Rice	`Os02g0177600` (4CL3) - identity=55.7; qcov=0.912; evalue=4.78e-86; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00501 (AMP-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811502.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811502.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811502.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811502.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26812564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B132,B55,C35
`Chr5:26812569`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A11,A3,A7,B105,B113,B114,B127,B13,B130,B136,B20,B25,B26,B36,B40,B44,B45,B52,B61,B64,B8,C29,C38,C49,C54,C58,C73,C75,C85,D10,D11,D5,D6
`Chr5:26812571`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A20,A21,A9,B107,B119,B123,B134,B136,B140,B16,B56,B6,B80,B87,B96,C28,C3,C39,C61,C67,D11
`Chr5:26812572`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A11,A3,A7,B105,B113,B114,B127,B13,B130,B20,B25,B26,B36,B40,B44,B45,B52,B61,B64,B8,C29,C38,C49,C54,C58,C73,C75,C85,D10,D5,D6
`Chr5:26812573`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A15,A18,A6,B103,B110,B122,B131,B132,B139,B23,B24,B28,B31,B34,B35,B41,B5,B50,B55,B57,B69,B74,B84,B9,B94,C13,C14,C19,C21,C34,C35,C36,C37,C43,C46,C47,C50,C57,C60,C62,C7,C71,C72,C74,C77,C86,C9,D1,D2,D4
`Chr5:26812594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:26812603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:26812613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,C3,C53,D10
`Chr5:26812649`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	97	A10,A13,A16,A18,A19,A25,A4,A6,A8,B100,B101,B104,B109,B11,B117,B118,B120,B124,B125,B126,B128,B133,B135,B138,B14,B15,B19,B23,B24,B29,B3,B30,B4,B41,B46,B49,B5,B50,B51,B54,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B66,B67,B70,B73,B74,B76,B83,B84,B85,B88,B89,B90,B91,B95,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C25,C30,C34,C37,C41,C44,C45,C46,C47,C5,C55,C59,C60,C63,C64,C66,C69,C7,C70,C71,C77,C81,C83,C87,D1,D8,D9
`Chr5:26812755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C74
`Chr5:26812764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A18,B106,B139,B18,B34,B64,B72,B73,B94,C34,C36,C43,C53,C57,C7,C79,D1
`Chr5:26812785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811502.1

240 aa

120

240

AMP-binding

PF00501 AMP-binding 9-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811502.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	9	220	8.5e-50	170.4	AMP-binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955519.1
CCCATCATCAACGGCATGACGGACGACGTGTACACGTACAAGCAGGTGGAGATGACGGCGCGCAAAGTGGCGTCGGGGCTGAGCCAGGTGGGCATCCAGCAGGGCGAGACGATCATGCTTCTCCTCCCCAACACGCCCGAGTACATCTTCGCATTCCTTGGCGCGTCCTACATAGGCGTGGTCTCCACCATGGTGAATCCCTTCTTCACCCCAGCCGAGGTGATCAAGCAGGCCAAGGCCTCCGCGGCCAAGCTCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025729
CCCATCATCAACGGCATGACGGACGACGTGTACACGTACAAGCAGGTGGAGATGACGGCGCGCAAAGTGGCGTCGGGGCTGAGCCAGGTGGGCATCCAGCAGGGCGAGACGATCATGCTTCTCCTCCCCAACACGCCCGAGTACATCTTCGCATTCCTTGGCGCGTCCTACATAGGCGTGGTCTCCACCATGGTGAATCCCTTCTTCACCCCAGCCGAGGTGATCAAGCAGGCCAAGGCCTCCGCGGCCAAGCTCATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811502.1
PIINGMTDDVYTYKQVEMTARKVASGLSQVGIQQGETIMLLLPNTPEYIFAFLGASYIGVVSTMVNPFFTPAEVIKQAKASAAKLIITQACYVDMVRDYAAEAGAKVVCIDVPPAGCLAFSELTAADEREMPTMKIHPEDAVALPYSSGTMGLPKGVMLTHKGLVTSVAQQVDGKNPNLYIHSEDVMLCVLPLFHIYSLNSVLLCGLRVGAAILIMKAVDSRCSVGPVFNNKKNYFLDDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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