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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002433`

染色体: Chr05 坐标: 26822825-26825986 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002433`
名称	SmilChr05G002433
描述	oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26822825 - 26825986 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026207`
GeneID	`131026207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026207`
原始查询	`SmilChr05G002433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, chloroplastic
产物	oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G03475` (LIN2) Coproporphyrinogen III oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839489] identity=78; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0610800` (CPO) - identity=78.2; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004109 (coproporphyrinogen oxidase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006782 (GO:0006782); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01218 (Coprogen_oxidas)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811969.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057811969.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057811969.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811969.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26823578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:26825145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr5:26825372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:26825458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B89
`Chr5:26825884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811969.1

394 aa

197

394

Coprogen_oxidas

PF01218 Coprogen_oxidas 91-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811969.1`	Pfam	`PF01218`	Coprogen_oxidas	Domain	91	393	2e-137	457.5	Coproporphyrinogen III oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955986.1
GGGGAGGGGTAAAGGTCAAAAACCCAGTGTGTTTTGAGTCAAATAGAAATCGATCCCCATCTTATCATCATCTTCATCCACATCACCGGCAATGCTGACGCCGGCACTTACCGCTCCCTCTTCTTCTTCTTGCCCCGCCGTGCTTCCTTTCTCCCATTCGCTCCGCACTTTGAGTTTCCCCCTTGTTGTCGCAAGACTACCCACTTCCAGGAGGCCACAATTTCGAATCCAAGCTTCGTCTTCGTCTTCTTCCCAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026207
ATGCTGACGCCGGCACTTACCGCTCCCTCTTCTTCTTCTTGCCCCGCCGTGCTTCCTTTCTCCCATTCGCTCCGCACTTTGAGTTTCCCCCTTGTTGTCGCAAGACTACCCACTTCCAGGAGGCCACAATTTCGAATCCAAGCTTCGTCTTCGTCTTCTTCCCAATCCCGAATGATCGAGCAGGAGATCCCCGCTGCCGAAAGGCCTCCCACTTTCCTTCGAGAAGTTGACGAGGATTCTTCCAATTCTTCCGATTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811969.1
MLTPALTAPSSSSCPAVLPFSHSLRTLSFPLVVARLPTSRRPQFRIQASSSSSSQSRMIEQEIPAAERPPTFLREVDEDSSNSSDSVRARFEKMIREAQDSVCSAIEAADGGAKFKEDVWSRPGGGGGISRVLQDGAVWEKAGVNVSVVYGVMPPEAYRAANPSQNGNIKPGPVPFFAAGISSVLHPKNPFAPTLHFNYRYFETDAPKDAPGAPRQWWFGGGTDLTPAYIFEEDVKHFHQVQKDTCDKFNSDFYPRFKKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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