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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002439`

染色体: Chr05 坐标: 26889656-26892453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002439`
名称	SmilChr05G002439
描述	uncharacterized SmilChr05G002439
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26889656 - 26892453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026212`
GeneID	`131026212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026212`
原始查询	`SmilChr05G002439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818057]; symbol=EDA18; hit=AT2G34920; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818057]; symbol=EDA18; hit=AT2G34920; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G34920` (EDA18) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818057] identity=30.6; qcov=1.02; evalue=4.31e-59; confidence=low
Rice	`Os07g0499800` (OsRFP) - identity=29.6; qcov=1.02; evalue=7.95e-47; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057811975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811975.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811975.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811975.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26889922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B140,B75
`Chr5:26890041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,C73,D6
`Chr5:26890044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:26890461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:26890674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A18,B23,C43,D1
`Chr5:26891008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D3
`Chr5:26891097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:26891220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B89
`Chr5:26891635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B125,C12
`Chr5:26891730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:26891874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:26891990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C29,C38,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811975.1

657 aa

328

657

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 607-649 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811975.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	607	649	1.6e-09	38.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955992.1
GGGAAAGCGTGGTTATTGGAACTAACTCAACGGTCGCCCACACATTTATTTAGTTGCATGGATGCCTGCATCTTCAACCCGCCCCCTCACGGCGGCCCCTAATCATTGTTCCTTCCTTGATCAAATATTGTTTTGCTCAGAAAGAACCACAATTAATCATTACTATTATAATCAAATGGCTTCTTGATTGTCGATGGCCTCTTTCCAAGTCGAGATCGTCCCCTCCTCTCCCTTCTTCCAGAACAATCTCAACAACTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026212
ATGGCCTCTTTCCAAGTCGAGATCGTCCCCTCCTCTCCCTTCTTCCAGAACAATCTCAACAACTTGGATCTGGGCGATCTGTGGGTTCACCAACCGCAATGGCAAACCGCCACCGATGCTCAATGCGGCAGCAGCAAGGACAAATGGGCTCGGGCGAGGGAGATTGTATTTCCCGCCAACGCCACTCCTCCCAAGGCCCCCCATAATCCGAATGCTGGCGGCGTGTCTTCCCTGGTCCAGAAATGGAGAGGCTTCGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811975.1
MASFQVEIVPSSPFFQNNLNNLDLGDLWVHQPQWQTATDAQCGSSKDKWARAREIVFPANATPPKAPHNPNAGGVSSLVQKWRGFEAGSGAGKRVAPPPPPLPPAPLPMDDDSIGDWESDRTVLSGRSSIRGRDSDATESERLRVVDIIRKLTPNEAGSVSPPRIRTSLDQAYVSPSPRIRGRQAYLDLLAQRNRDRRKEIHALHARKSVSKFSHRGRIQAVLKLKLLRRGMEPNTIPFPSPKPINFRPRVNQKAQNSST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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