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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002442`

染色体: Chr05 坐标: 26908954-26911660 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002442`
名称	SmilChr05G002442
描述	uncharacterized SmilChr05G002442
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26908954 - 26911660 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026215`
GeneID	`131026215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026215`
原始查询	`SmilChr05G002442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0005E02.120; symbol=P0005E02.120; hit=Os07g0498300; species=rice; confidence=medium
产物	P0005E02.120; symbol=P0005E02.120; hit=Os07g0498300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G20150` (AT4G20150) excitatory amino acid transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827761] identity=76.5; qcov=1; evalue=2.8e-44; confidence=medium
Rice	`Os07g0498300` (P0005E02.120) - identity=75.3; qcov=1; evalue=2.02e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31061 (NDUC2_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057811979.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057811979.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057811979.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811979.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26909225`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr5:26909225`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811979.1

91 aa

NDUC2_plant

PF31061 NDUC2_plant 1-77 aa

XP_057811980.1

81 aa

NDUC2_plant

PF31061 NDUC2_plant 1-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811979.1`	Pfam	`PF31061`	NDUC2_plant	Domain	1	77	4.8e-43	145.9	NDUC2 subunit
`XP_057811980.1`	Pfam	`PF31061`	NDUC2_plant	Domain	1	80	2.6e-45	153.2	NDUC2 subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955997.1
TAATTTATCTATTTTTATAGCAAGAAAAGATTCACTAAACGGGCTCTTTTTTTGGGCCTGGCAGTACAAATTTGTAATCAAATGTGGCCCATACAGGGCAGGGCCTATGAAATATTTCAGGCGTCGTCGTCATTGTAATACAACTCAGTGAAAAACTTGCAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGGAGATGGCAATCAGCGCGACTATGTTCGGAGCCCTACTGGGAATGGGGACCCAGATGTACTCTAACGCTCTCCGCAAGCT...

XM_057955996.1
CTTTTTTTGGGCCTGGCAGTACAAATTTGTAATCAAATGTGGCCCATACAGGGCAGGGCCTATGAAATATTTCAGGCGTCGTCGTCATTGTAATACAACTCAGTGAAAAACTTGCAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGGAGATGGCAATCAGCGCGACTATGTTCGGAGCCCTACTGGGAATGGGGACCCAGATGTACTCTAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGCTGGGAATGGGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026215
ATGGCAATCAGCGCGACTATGTTCGGAGCCCTACTGGGAATGGGGACCCAGATGTACTCTAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGCTGGGAATGGGTTTGGGGGCGCTATTCGTTAACCAATTGATCAAGTTCGATGCAAAGGCTCAGGAGGATCTCGACAAATTGCTCATCAAGGCCAAAGAAGCCAACGAACGCCGCTACTTTGATGATGATGAAGAATAA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811979.1
MAISATMFGALLGMGTQMYSNALRKLPYMRHPWEHVLGMGLGALFVNQLIKFDAKAQEDLDKLLIKAKEANERRYFGSILALPIPFLIAHF

XP_057811980.1
MAISATMFGALLGMGTQMYSNALRKLPYMRHPWEHVLGMGLGALFVNQLIKFDAKAQEDLDKLLIKAKEANERRYFDDDEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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