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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002456`

染色体: Chr05 坐标: 27109019-27110858 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002456`
名称	SmilChr05G002456
描述	uncharacterized SmilChr05G002456
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27109019 - 27110858 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026230`
GeneID	`131026230`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026230`
原始查询	`SmilChr05G002456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0560700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0560700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30910` (AT1G30910) Molybdenum cofactor sulfurase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839975] identity=60.1; qcov=0.968; evalue=1.09e-130; confidence=high
Rice	`Os09g0560700` - identity=59.3; qcov=0.981; evalue=6.3e-133; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0030151 (molybdenum ion binding); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF03473 (MOSC); PF03476 (MOSC_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026230

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811999.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057811999.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057812000.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811999.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27109206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A23,A4,B129,B140,B16,B63,B65,B86,C17
`Chr5:27109266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B140
`Chr5:27109544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:27109578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:27110116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr5:27110116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:27110165`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr5:27110165`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811999.1

315 aa

158

315

MOSC_N

MOSC

PF03476 MOSC_N 8-134 aa PF03473 MOSC 158-253 aa

XP_057812000.1

308 aa

154

308

MOSC_N

MOSC

PF03476 MOSC_N 8-134 aa PF03473 MOSC 158-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811999.1`	Pfam	`PF03476`	MOSC_N	Domain	8	134	3.7e-38	130.7	MOSC N-terminal beta barrel domain
`XP_057811999.1`	Pfam	`PF03473`	MOSC	Domain	158	253	3.1e-17	63.4	MOSC domain
`XP_057812000.1`	Pfam	`PF03476`	MOSC_N	Domain	8	134	3.6e-38	130.8	MOSC N-terminal beta barrel domain
`XP_057812000.1`	Pfam	`PF03473`	MOSC	Domain	158	294	1.3e-19	71.0	MOSC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956017.1
ATTTAATGGATGATAAAAGGAAAAAATATGAAATTATTTGAGGGAAGGAGCTTGGAAGGGAGTAATAATAATAACTCCCCACCCGTCACGTCATCCACGTGATTACCGAACAAACATGCACTAAAACGAGTAAATTGTCCCTACCACTGTCTGATTAAGCAGCTAGAAACTGATGCACGTAATCTAGTTTTCTGCATTTTGATGAATATAGTATCCAGGGTTTTAGAGTAAGGCTGTTTGAAAACAGATCCGATCCTCAT...

XM_057956016.1
AAGGAGCTTGGAAGGGAGTAATAATAATAACTCCCCACCCGTCACGTCATCCACGTGATTACCGAACAAACATGCACTAAAACGAGTAAATTGTCCCTACCACTGTCTGATTAAGCAGCTAGAAACTGATGCACGTAATCTAGTTTTCTGCATTTTGATGAATATAGTATCCAGGGTTTTAGAGTAAGGCTGTTTGAAAACAGATCCGATCCTCATAGTAAAGGTTGTTGAAGATGGCGGAAGCTCCTGTGCCTGTGGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026230
ATGGCGGAAGCTCCTGTGCCTGTGGTGAAGACCATATTCGTCTACCCCGTCAAGTCGTGCCAGGGAATATCCGTTTCACAAGCTACACTTACTTCAAATGGATTACGGTGGGATCGTCTTTGGATGATTGTGAATTCCAAAGGCAGGATGTGCACTCAGAGAGTCGAACCTAAACTTGCTCTCATACAAGTTGAATTGCCAACTGATGCATTTTCTCAAGCCTGGGAACCAGATAAGGCCTCCTTCTTGGTGATAAATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811999.1
MAEAPVPVVKTIFVYPVKSCQGISVSQATLTSNGLRWDRLWMIVNSKGRMCTQRVEPKLALIQVELPTDAFSQAWEPDKASFLVINAPGMNTLKIPMVQPCAVSNGVSVWEWSGSAFDEGDEAAKWFSDFLGKPSRLVRFDEASECRTVNSDYARSHTIKFNDLYPFLLISQGSLNALNARLSEPVLINRFRPNFLVDGCQPFSEDLWNEIKINEFVFVGGELCYRCKVPTVNQETAETGAEPTETLMKFRSDKILVPNK...

XP_057812000.1
MAEAPVPVVKTIFVYPVKSCQGISVSQATLTSNGLRWDRLWMIVNSKGRMCTQRVEPKLALIQVELPTDAFSQAWEPDKASFLVINAPGMNTLKIPMVQPCAVSNGVSVWEWSGSAFDEGDEAAKWFSDFLGKPSRLVRFDEASECRTVNSDYARSHTIKFNDLYPFLLISQGSLNALNARLSEPVLINRFRPNFLVDGCQPFSEDLWNEIKINEFVFVGGELCYRCKVPTVNQETAETGAEPTETLMKFRSDKILVPNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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