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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002458`

染色体: Chr05 坐标: 27118068-27119384 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002458`
名称	SmilChr05G002458
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27118068 - 27119384 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025732`
GeneID	`131025732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025732`
原始查询	`SmilChr05G002458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=26.8; qcov=0.445; evalue=1.59e-06; confidence=low
Rice	`Os04g0590366` - identity=31.4; qcov=0.53; evalue=1.12e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811504.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811504.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811504.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811504.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27118075`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B17,B24,B43,B60,C10,D7
`Chr5:27118077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C10
`Chr5:27118423`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A2,A3,B101,B133,B20,B33,B46,B5,B59,B96,B99,C11,C16,C27,C28,C33,C41,C43,C51,C55,C58,C71,C8,D9
`Chr5:27118427`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A2,A3,B101,B107,B133,B20,B33,B46,B5,B59,B96,B99,C11,C16,C27,C28,C33,C41,C43,C51,C52,C55,C58,C71,C8,D2,D9
`Chr5:27118447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B69,B9,C37
`Chr5:27118452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:27118466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:27118469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C37,C54,C56
`Chr5:27118480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A9,B108,B11,B115,B140,B21,B23,B50,B57,B60,B72,B76,B93,C49,C59,C82
`Chr5:27118486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B9,B91,C37,C8
`Chr5:27118487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C18
`Chr5:27118492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B95,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811504.1

319 aa

160

319

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811504.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	123	9.2e-09	36.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955521.1
ATGAGCCAAGCAACCCAAGGCAGCAACGGAACTACACGTTCCAGCCGAGCCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGTTCTTGGTCCAATCACGAAGAACAGGTGTTGATCGCATCGTTGAAAGAGCTCGTTGCACAAGGCTGGAAATCCGACAACGGATTTCGTGGTGGCTATTTGAATAAGTTAGAGGAGGCTATGAGAAAGGAGTTCCCGACCACTGACTTGAAAGGAATGCCTCATATTAACTCCAAGGTGACAACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025732
ATGAGCCAAGCAACCCAAGGCAGCAACGGAACTACACGTTCCAGCCGAGCCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGTTCTTGGTCCAATCACGAAGAACAGGTGTTGATCGCATCGTTGAAAGAGCTCGTTGCACAAGGCTGGAAATCCGACAACGGATTTCGTGGTGGCTATTTGAATAAGTTAGAGGAGGCTATGAGAAAGGAGTTCCCGACCACTGACTTGAAAGGAATGCCTCATATTAACTCCAAGGTGACAACGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811504.1
MSQATQGSNGTTRSSRANKTDQKRRSWSNHEEQVLIASLKELVAQGWKSDNGFRGGYLNKLEEAMRKEFPTTDLKGMPHINSKVTTWKKTYYSLWNILKVSGVGFNVNGKHMIDCDDEQWQNFVAADKNVTNFRYKSWPYLEDWKLIFGKDRATGDEAEDLMEAAHDMYRKLDQLDENGDYHVSLEDIFENEILGDNVSQTRIPEESVPVEKEAPTSSKKRRRSIGFDDRFFEALHEVGRGTESRLETISSRMGYDFDIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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