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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002468`

染色体: Chr05 坐标: 27197624-27199013 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002468`
名称	SmilChr05G002468
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27197624 - 27199013 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026242`
GeneID	`131026242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026242`
原始查询	`SmilChr05G002468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
产物	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
Arabidopsis	`AT3G05170` (AT3G05170) Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819681] identity=58; qcov=0.913; evalue=4.61e-109; confidence=high
Rice	`Os05g0141700` - identity=64.6; qcov=0.81; evalue=5.78e-100; confidence=high
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00300 (His_Phos_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812022.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812022.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057812022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27197913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:27198041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B79,D7
`Chr5:27198044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B24,B78,B93,C23
`Chr5:27198068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B136,B58,C33
`Chr5:27198257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:27198376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:27198394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr5:27198416`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr5:27198416`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr5:27198509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:27198675`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A13,A16,A2,A3,A7,B10,B102,B103,B105,B106,B109,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B127,B137,B139,B140,B20,B21,B22,B28,B29,B31,B36,B44,B48,B5,B51,B52,B53,B55,B58,B6,B60,B73,B74,B77,B80,B82,B84,B87,B97,B98,C14,C18,C25,C26,C29,C30,C31,C33,C36,C4,C42,C49,C51,C54,C61,C63,C76,C78,C80,C85,D1,D11,D5,D8,D9
`Chr5:27198699`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A16,A2,A6,B106,B109,B110,B117,B120,B130,B131,B136,B139,B140,B24,B5,B55,B58,B6,B60,B74,B78,B82,B93,C14,C18,C23,C33,C36,C63,C78,C85,D1,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812022.1

300 aa

150

300

His_Phos_1

PF00300 His_Phos_1 44-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812022.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	44	243	9.1e-26	91.5	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956039.1
GAAGTTTGTCATGTATTTTTGCTTTCTTCAAAACAAATCGCATTGATTCTAGGATTTCTGAGTATGTGATCATGATCCTATCATGTTCATGTGATTGATTTTGAGATTTTTATGAATCACCACTTTGTCTCTCTCACTCGATTTCTTCCAAGATTGGTAGCCCGTTTTGGTGAATGAAGACTGTTGACACGGCCAAAAGAAACTGTCAAAGGTTTTTGTATATACATAGCCAGAATCCCCAACCAAACCATCCTAGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026242
ATGAAGACTGTTGACACGGCCAAAAGAAACTGTCAAAGGTTTTTGTATATACATAGCCAGAATCCCCAACCAAACCATCCTAGATCAGATCCCACCATGGCTGCCAAGAATAGGTGGCTTCCAAAGCGTATAATCTTGGTCCGCCATGGCGAGAGCAACGACAACGATGATGGCCCCAGTCACAGCACCCCACTGAGCCGGCGGGGGGCGGAGCAGGCGAGGCGAGCAGGCACCCGCATCCGGGATCTCCTAGACCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812022.1
MKTVDTAKRNCQRFLYIHSQNPQPNHPRSDPTMAAKNRWLPKRIILVRHGESNDNDDGPSHSTPLSRRGAEQARRAGTRIRDLLDQSCSSWKIYVYVSPYECTRSTLREMGRAFPASRLIGVREECRVREQDFGNFQDPQKMRQLKEIRNKFGRFFFRFPEGESGADVFDRVSSFLESMWRDIDMQRFPLDGDDELNLIIVSHGLAIRIFLMRWFRWTVEQFERLKNPKNCEFRVMQLGEGGEYSLAVHHDEPRLKAWGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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