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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002478`

染色体: Chr05 坐标: 27289853-27292284 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002478`
名称	SmilChr05G002478
描述	polygalacturonase QRT3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27289853 - 27292284 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026251`
GeneID	`131026251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026251`
原始查询	`SmilChr05G002478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase QRT3-like
产物	polygalacturonase QRT3-like
Arabidopsis	`AT4G20050` (QRT3) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827750] identity=59.1; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0613200` - identity=57.3; qcov=0.826; evalue=4.09e-169; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity)
KEGG	-
Pfam	PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812032.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812032.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812032.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812032.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27290880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:27290906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B25,C7,C75,D9
`Chr5:27290988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:27291181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B23
`Chr5:27291274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:27291454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B23
`Chr5:27291565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B99,D11
`Chr5:27291581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B23,C9
`Chr5:27291583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B65,D11
`Chr5:27291697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:27291733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B23,C9
`Chr5:27292039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812032.1

507 aa

254

507

Pect-lyase_RHGA_epim

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 103-322 aa

XP_057812033.1

507 aa

254

507

Pect-lyase_RHGA_epim

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 103-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812032.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	103	322	1.6e-06	28.8	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057812033.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	103	322	1.6e-06	28.8	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956049.1
GTTGGTAATATACAAGCCCATTAAAGCTGATAAAAGTTGTAATCCAAAGTTGAAGTTGAGGTTGAGGTCCCCGATCTTTCCGTGATTTTATAATCAATTCCCAAATCCTCTCTTTCTCTCTCTATATAAAGCGAGAGTTGTAGGGCAGCATGACAAACGACCAAGAATTCCACGCAGACTGCCCGAGAGCCGACAGAAACATGGGAGCTTCCATGATAGCTATATTCTTCTTCACCGTGGCGGCGACAGCCAGTTTGCTG...

XM_057956050.1
AAGAGGATGGTAAGTCGTAAAAATTAGGCAATTTTGATTGGGGGCGAAAATCTGAAGAAGCATTGAATGGTTATAAATAATTGTTAACGTTCACCAGAAAACAAACATCAAAAGAGAGCTTATAACATAATCCAGGTGATTTTGGCATGATTCAGCGAGAGTTGTAGGGCAGCATGACAAACGACCAAGAATTCCACGCAGACTGCCCGAGAGCCGACAGAAACATGGGAGCTTCCATGATAGCTATATTCTTCTTCACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026251
ATGACAAACGACCAAGAATTCCACGCAGACTGCCCGAGAGCCGACAGAAACATGGGAGCTTCCATGATAGCTATATTCTTCTTCACCGTGGCGGCGACAGCCAGTTTGCTGGTGGTCCACGTGTACGGCGTGCCCAAGAGAGCCGATCATTTCCCCCGCAAGAATGTGTACCTGCACCAAATGCAGCAGATTAGAGCCGCATCCGATTCTTGGTCAAGTCCGCCGCGCCCTACCACGGAGATGCGCAGTCTTCAACAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812032.1
MTNDQEFHADCPRADRNMGASMIAIFFFTVAATASLLVVHVYGVPKRADHFPRKNVYLHQMQQIRAASDSWSSPPRPTTEMRSLQQDSPPPSSSATGPRVYHVTAYGADPTGQNDSTDAILKAIGDALNGPGKGVLCEGIVNLGGARIDLDGGNYLITRPLLFPISGRGNLAIHGGSLTASNDFPNDAYLIDLSSKSSSSAYNYEFITLRDLLLDSNYRGGGIKVTNSLRTTIDNCYVTHFNTTGILAQGGHETYIRNSY...

XP_057812033.1
MTNDQEFHADCPRADRNMGASMIAIFFFTVAATASLLVVHVYGVPKRADHFPRKNVYLHQMQQIRAASDSWSSPPRPTTEMRSLQQDSPPPSSSATGPRVYHVTAYGADPTGQNDSTDAILKAIGDALNGPGKGVLCEGIVNLGGARIDLDGGNYLITRPLLFPISGRGNLAIHGGSLTASNDFPNDAYLIDLSSKSSSSAYNYEFITLRDLLLDSNYRGGGIKVTNSLRTTIDNCYVTHFNTTGILAQGGHETYIRNSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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