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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002490`

染色体: Chr05 坐标: 27562330-27563180 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002490`
名称	SmilChr05G002490
描述	uncharacterized SmilChr05G002490
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27562330 - 27563180 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025738`
GeneID	`131025738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025738`
原始查询	`SmilChr05G002490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.3; qcov=0.856; evalue=9.75e-15; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=28.3; qcov=0.895; evalue=1.49e-24; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811508.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811508.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811508.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811508.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27562331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B109,B49
`Chr5:27562338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C45,C67
`Chr5:27562352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr5:27562360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C45,C67
`Chr5:27562376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A8,C81
`Chr5:27562378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B78,C43,C56
`Chr5:27562379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B100
`Chr5:27562387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:27562399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C56
`Chr5:27562404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A16,B100,B18,B41,B54,B61,B66,C12,C30,C41,C49,D1
`Chr5:27562408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B134,B74,C12,C28
`Chr5:27562413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A10,B34,B41,B82,B83,B89,C16,C3,C45,C48,C59,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811508.1

257 aa

128

257

SWIM

PF04434 SWIM 87-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811508.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	117	4e-08	33.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955525.1
ATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGATGAACAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGTTCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGAAAGTTGCATGTGGCTGTCGAAGTGGGTCGGCAATTGGCTGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGTATTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025738
ATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGATGAACAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGTTCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGAAAGTTGCATGTGGCTGTCGAAGTGGGTCGGCAATTGGCTGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGTATTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811508.1
MTSNAAETMNSRLLWARRLPVASLFETYRAIMEKWFDRRRISAASRSHELTEVVEGKLHVAVEVGRQLAVRGTTTHMFSVEDDHVFYIVDLENRTCSCAQFDLDDIPCRHACAAIRRAGLQVTDFVGRYFKQSVLLATYMERIVPVPHPTYWNVPDEISAYVVKPPDITVHAGRPKLSRARSAVEGSPNSRPQVCSRCKGRGHNAQRCKAQVLALDLNVPVEGVEQPPDARRRRKKICGICRSGTHTRNACPQNVGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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