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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002493`

染色体: Chr05 坐标: 27608457-27609501 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002493`
名称	SmilChr05G002493
描述	pyruvate kinase 1, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27608457 - 27609501 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026265`
GeneID	`131026265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026265`
原始查询	`SmilChr05G002493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyruvate kinase 1, cytosolic-like
产物	pyruvate kinase 1%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT3G52990` (AT3G52990) Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824465] identity=85.6; qcov=0.994; evalue=4.59e-98; confidence=high
Rice	`Os11g0148500` (OsPK1) - identity=86.2; qcov=0.994; evalue=1.35e-98; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00224 (PK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812048.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057812048.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057812048.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057812048.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057812048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27608637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr5:27608639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,C86,D1,D3
`Chr5:27608766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,D7
`Chr5:27608767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B7,B71,C78
`Chr5:27608769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B57,B75,C86
`Chr5:27608778`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B114,B117,B34,B83,C59
`Chr5:27608969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B92,C86
`Chr5:27608994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,C78
`Chr5:27609119`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C80
`Chr5:27609119`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812048.1

161 aa

161

PF00224 PK 2-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812048.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	2	98	1e-34	120.9	Pyruvate kinase, barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956065.1
AAAGATGGTGGTTTCAGGCACGCGAGTTTCTTTCTACGTTGGGTGACCTCAACCAGACTCTGATCTTTGCAAAGATCGACAATGTGGAGGGAATGACTCATTTTGATAATCTCCTTGAAAAAGCTGATGGAATCATCCTCTCTCGTGGGAATCTTGGGATCGATCTCCCACCAGAGAAGGTGTTTTTGTTCCAGAAGGAAGCTGTTCACAAGTGCAACATGGCAGGGAAGCCGGCAGTGGTGACTCGTGTCGTGGACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026265
ATGACTCATTTTGATAATCTCCTTGAAAAAGCTGATGGAATCATCCTCTCTCGTGGGAATCTTGGGATCGATCTCCCACCAGAGAAGGTGTTTTTGTTCCAGAAGGAAGCTGTTCACAAGTGCAACATGGCAGGGAAGCCGGCAGTGGTGACTCGTGTCGTGGACAGTATGGCTGACAACTTGAGGCCTACTCGTGCAGAGGCAACTGATGTCGCCAATGCTGTTTTAGATGGCAGTGATGCAATCCTGCTAGGAACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812048.1
MTHFDNLLEKADGIILSRGNLGIDLPPEKVFLFQKEAVHKCNMAGKPAVVTRVVDSMADNLRPTRAEATDVANAVLDGSDAILLGTETVRGLYPVETISVVRKICAEAEKVYNQNLYFKKTVKFVGEPMSHLESIASSAVQAAIKVKASVIICFTSSRKSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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