当前解析结果
SmilChr05G002517| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002517 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002517 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002517 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 27953724 - 27955181 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025742 |
|---|---|
| GeneID | 131025742 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025742 |
| 原始查询 | SmilChr05G002517 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=26.5; qcov=0.449; evalue=5.43e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025742 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811512.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057811512.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811512.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811512.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811512.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:27953732 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:27953735 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B46,C20,C6 |
Chr5:27953748 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A3,B75,C74 |
Chr5:27953767 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B35,B46,C23 |
Chr5:27953784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B19,B24,B55,C85 |
Chr5:27953793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B33,C1,C12 |
Chr5:27953793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B33,C1,C12 |
Chr5:27953796 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A24,B109,B19,D6 |
Chr5:27953796 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B109,B19,D6 |
Chr5:27953802 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B50,C13 |
Chr5:27953810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B91,C58 |
Chr5:27953833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,C14,C6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。