当前解析结果
SmilChr05G002527| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002527 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002527 |
| 描述 | protein PHLOEM PROTEIN 2-LIKE A9-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 28105201 - 28106014 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026316 |
|---|---|
| GeneID | 131026316 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026316 |
| 原始查询 | SmilChr05G002527 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein PHLOEM PROTEIN 2-LIKE A9-like |
| 产物 | protein PHLOEM PROTEIN 2-LIKE A9-like |
| Arabidopsis | AT1G10155 (PP2-A10)phloem protein 2-A10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837553] identity=36.9; qcov=1.08; evalue=3.73e-31; confidence=medium |
| Rice | Os01g0158400- identity=27; qcov=0.988; evalue=2.47e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14299 (PP2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026316 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057812144.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057812144.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057812144.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812144.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812144.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057812144.1PF14299
PP2 27-159 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057812144.1 |
Pfam | PF14299 |
PP2 | Family | 27 | 159 | 8.8e-20 | 71.9 | Phloem protein 2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。