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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002532`

染色体: Chr05 坐标: 28163150-28165359 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002532`
名称	SmilChr05G002532
描述	uncharacterized SmilChr05G002532
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28163150 - 28165359 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025746`
GeneID	`131025746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025746`
原始查询	`SmilChr05G002532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=28.9; qcov=0.528; evalue=1.55e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811516.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811516.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811516.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811516.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28163157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B92
`Chr5:28163162`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A13,A14,B104,B111,B126,B132,B42,B43,B53,C3,C5,C50,D10
`Chr5:28163164`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	163	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B3,B31,B33,B34,B35,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B47,B49,B50,B53,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B72,B73,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B9,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C40,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C54,C55,C56,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C84,C85,C86,C87,D10,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr5:28163168`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	144	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A23,A24,A25,A4,A5,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B107,B109,B11,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B31,B33,B34,B35,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B47,B49,B50,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B73,B76,B77,B80,B81,B82,B83,B84,B9,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C32,C33,C35,C36,C40,C44,C45,C47,C48,C54,C55,C56,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C84,C85,C86,C87,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr5:28163174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C33
`Chr5:28163181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C80
`Chr5:28163200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B12,B130,B45,C68
`Chr5:28163257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C64,C8
`Chr5:28163260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C80
`Chr5:28163265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B65,C76,D6
`Chr5:28163270`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B10,B30,B45,B78,D3
`Chr5:28163270`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B10,B30,B45,B78,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811516.1

690 aa

345

690

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 53-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811516.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	53	118	7.3e-10	39.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955533.1
ATGACGTGCAGAAGGAAAAGAAGGGAACATGGGAGATACAAGGAGGACAAGAGGGCCAAGACGTCAAGGTTCCACCCCATCAACAACCGTAGTCCTTTTTCCGATGACATCCTGGCGGATACTTTGCCAAGAAGCTACAAACCCATTTCTCTGGATTACGATGGTACCACTGATCCGGAGGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGACTGGTTACTCTACACATGTATACTGAGGGCATCAAGTGCCGCATATTCTCCACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025746
ATGACGTGCAGAAGGAAAAGAAGGGAACATGGGAGATACAAGGAGGACAAGAGGGCCAAGACGTCAAGGTTCCACCCCATCAACAACCGTAGTCCTTTTTCCGATGACATCCTGGCGGATACTTTGCCAAGAAGCTACAAACCCATTTCTCTGGATTACGATGGTACCACTGATCCGGAGGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGACTGGTTACTCTACACATGTATACTGAGGGCATCAAGTGCCGCATATTCTCCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811516.1
MTCRRKRREHGRYKEDKRAKTSRFHPINNRSPFSDDILADTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCRIFSTTLTGLAQLWFGTLAPNSIRSFEELQVRFLRQFASSRRVGKSALSLMDIKHDQNEILREYTARFNLAALEVPEAESQIKNCAYVRGLKPGLFFDELQIRPARDFDDIMSRLPGYLQLEDARMARKAENDKHKAKRAEEAPERQRHQEGPLSEDYPLGAPGTYRDGQPQQGPNNKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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