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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002540`

染色体: Chr05 坐标: 28350707-28351219 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002540`
名称	SmilChr05G002540
描述	zinc finger protein ZAT9-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28350707 - 28351219 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025749`
GeneID	`131025749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025749`
原始查询	`SmilChr05G002540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT9-like
产物	zinc finger protein ZAT9-like
Arabidopsis	`AT2G45120` (AT2G45120) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819119] identity=39.3; qcov=0.524; evalue=3.9e-15; confidence=low
Rice	`Os02g0659500` - identity=35.6; qcov=0.529; evalue=7.27e-10; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811518.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811518.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811518.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811518.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28350738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B11
`Chr5:28350739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A8,C31,C58,C75
`Chr5:28350746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B89,B99
`Chr5:28350757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B89,B99
`Chr5:28350766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B27
`Chr5:28350838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B89
`Chr5:28350841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B89
`Chr5:28350844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B4
`Chr5:28350856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B89
`Chr5:28350873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:28350912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:28350917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811518.1

170 aa

170

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 61-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811518.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	61	84	4.3e-09	36.8	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955535.1
ATGATGATGATGATGCAGAAGCTCAAGAAACCGAGAGTCGAGGCCAAGACGAGGAAGCTCGAATCACAAAACACAGAGGTTGAGGTTGGATGCGATGATGAGGTGGAAGTGAACTCGCCCAAGAACTTGAACAAGAAGAGTTTTAGGAAGGATAGAGAGGCAGAGAGAAACAACAGGAAATTCAGATGCTCAATGTGCAAGAAGGCGTTCCAGTTATACCAAGCTCTGGGAGGGCACAGGGCGAGCCACAATAAGTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025749
ATGATGATGATGATGCAGAAGCTCAAGAAACCGAGAGTCGAGGCCAAGACGAGGAAGCTCGAATCACAAAACACAGAGGTTGAGGTTGGATGCGATGATGAGGTGGAAGTGAACTCGCCCAAGAACTTGAACAAGAAGAGTTTTAGGAAGGATAGAGAGGCAGAGAGAAACAACAGGAAATTCAGATGCTCAATGTGCAAGAAGGCGTTCCAGTTATACCAAGCTCTGGGAGGGCACAGGGCGAGCCACAATAAGTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811518.1
MMMMMQKLKKPRVEAKTRKLESQNTEVEVGCDDEVEVNSPKNLNKKSFRKDREAERNNRKFRCSMCKKAFQLYQALGGHRASHNKFKGCCAPQETEDSQSQLGENLMIMMKKSKEHECPICFKVILSAKLWAATRDHHHHHHCFPLLSFSLTSTTTKISTTAKQHNNSKM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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