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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002549`

染色体: Chr05 坐标: 28525213-28540897 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002549`
名称	SmilChr05G002549
描述	nuclear pore complex protein NUP98A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28525213 - 28540897 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025751`
GeneID	`131025751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025751`
原始查询	`SmilChr05G002549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP98A-like
产物	nuclear pore complex protein NUP98A-like
Arabidopsis	`AT1G10390` (AT1G10390) Nucleoporin autopeptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837579] identity=53.8; qcov=0.531; evalue=3.44e-30; confidence=medium
Rice	`Os12g0166000` (OsNucAP3) - identity=42.2; qcov=0.537; evalue=5.76e-18; confidence=low
GO	GO:0000973 (post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006405 (RNA export from nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0044614 (nuclear pore cytoplasmic filaments)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811521.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.80000	`XP_057811521.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057811521.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057811521.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28525550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B45,C28
`Chr5:28525558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,C2,C32,C5,C52
`Chr5:28525565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D10
`Chr5:28525566`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B37,B6,C74
`Chr5:28525566`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B37,B6,C74
`Chr5:28525572`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A10,A13,A18,A4,A6,A8,B106,B118,B21,B25,B30,B31,B40,B46,B48,B54,B59,B61,B72,B77,B85,B86,B9,C25,C26,C35,C36,C40,C42,C58,C87,D8
`Chr5:28525573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B45,C72
`Chr5:28525578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B21,B65,D10
`Chr5:28525578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B65,D10
`Chr5:28525586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B106,C6,C67
`Chr5:28526439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:28526605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955538.1
ATGACTGATTCTCCTTTGAATTCAGGTCCATTGGCTGTTGCTGCACGTTCCTTTCACGTTCCATCTTTCTTCTGTGCTGAAGTATTCGTCTTCATCTGTAATGAAGTGGCGCATGACGATCCTTCGAGCATCTTGCACAAGATCAGTCTCTTTGATGATCTGATTTTGGAAGATAATCTACTTGAAGGAAATCTGCCAGAAAACCTTGGAAGTTTGAGTAATTTGAAGCTGTTTAGTATTATGACTACAAACACAGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025751
ATGACTGATTCTCCTTTGAATTCAGGTCCATTGGCTGTTGCTGCACGTTCCTTTCACGTTCCATCTTTCTTCTGTGCTGAAGTATTCGTCTTCATCTGTAATGAAGTGGCGCATGACGATCCTTCGAGCATCTTGCACAAGATCAGTCTCTTTGATGATCTGATTTTGGAAGATAATCTACTTGAAGGAAATCTGCCAGAAAACCTTGGAAGTTTGAGTAATTTGAAGCTGTTTAGTATTATGACTACAAACACAGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811521.1
MTDSPLNSGPLAVAARSFHVPSFFCAEVFVFICNEVAHDDPSSILHKISLFDDLILEDNLLEGNLPENLGSLSNLKLFSIMTTNTVLHHMNFKNFRLFGVSFCYSWNRNDYFVYLVSLARAISQGTASTFGTGLGFGNTQSSPLFQSTTPTLAQTSSPFGHTSAFGQSASGYGQSNLFSTPSTGFGGNLFSSSSSLLSSTGALGFGQTTPSLSTPFQSAQSAPGGFNFSNFGQSQAAAPSGFGGTPGMFSNTAFGQVPGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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