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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002555`

染色体: Chr05 坐标: 28686221-28690636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002555`
名称	SmilChr05G002555
描述	uncharacterized SmilChr05G002555
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28686221 - 28690636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026308`
GeneID	`131026308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026308`
原始查询	`SmilChr05G002555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840018]; symbol=AT1G31300; hit=AT1G31300; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840018]; symbol=AT1G31300; hit=AT1G31300; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G31300` (AT1G31300) TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840018] identity=66.8; qcov=0.985; evalue=2.28e-140; confidence=high
Rice	`Os03g0666700` - identity=61.2; qcov=0.956; evalue=1.62e-122; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane); GO:0055088 (lipid homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF03798 (TRAM_LAG1_CLN8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057812131.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057812131.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812131.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812131.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28690347`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A4,B100,B131,B2,B41,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812131.1

275 aa

138

275

TRAM_LAG1_CLN8

PF03798 TRAM_LAG1_CLN8 72-265 aa

XP_057812133.1

275 aa

138

275

TRAM_LAG1_CLN8

PF03798 TRAM_LAG1_CLN8 72-265 aa

XP_057812134.1

275 aa

138

275

TRAM_LAG1_CLN8

PF03798 TRAM_LAG1_CLN8 72-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812131.1`	Pfam	`PF03798`	TRAM_LAG1_CLN8	Domain	72	265	1.6e-30	107.2	TLC domain
`XP_057812133.1`	Pfam	`PF03798`	TRAM_LAG1_CLN8	Domain	72	265	1.6e-30	107.2	TLC domain
`XP_057812134.1`	Pfam	`PF03798`	TRAM_LAG1_CLN8	Domain	72	265	1.6e-30	107.2	TLC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956148.1
GCAATAAATTATCCGATTAATTAAATTAGCATGTTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCCTCTCTCATTCATTGTTTCGGTTGGAGATTCAATACACAGCACCACCCAACCGAGAAAACCAAAAAGGGAACACACTGCATTCACGTATTGACACACACACACCGTTTCCATTTTCTCGATAATCTTACATCGATTCTACTTTCCTTTCTCGTGCTTACTTCAACGTCTCTCCAAACTCTCCTTTTTCCCGTATTATTCGC...

XM_057956150.1
TTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCCTCTCTCATTCATTGTTTCGGTTGGAGATTCAATACACAGCACCACCCAACCGAGAAAACCAAAAAGGGAACACACTGCATTCACGTATTGACACACACACACCGTTTCCATTTTCTCGATAATCTTACATCGATTCTACTTTCCTTTCTCGTGCTTACTTCAACGTCTCTCCAAACTCTCCTTTTTCCCGTATTATTCGCCTTCAAGTTTCTCTTTCATCAATTTCCCAAACC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131026308
ATGGGGCGTTCTTTAAGAACTGTTGGGACACTTAAAGCTTATCAAAACCAGGCTGGTGTGCTGGTCAAAAACTATGTACTAGCGGATCCTTACATTCCATACACTTCTATTGTTCTTGGAATGTTGACTTGCAAATTGGCCTACGATCTATGTCAGCTCATCAGCACTTTTTATTCCAGAAATTATAATGCCCTTACTAAGATACAAAGGATGGAGTGGAATAACCGTGGCATTTCCACTCTCCATGCGGTTTTTATTTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057812131.1
MGRSLRTVGTLKAYQNQAGVLVKNYVLADPYIPYTSIVLGMLTCKLAYDLCQLISTFYSRNYNALTKIQRMEWNNRGISTLHAVFISIMSLYFVFWSELFSDQNHSGLVTFRNSSISTFALGLSVGYFLSDLGMICWRYPSLGGPEYVLHHSISAIAVAYAMYMGEGQLYTFMVLISEITTPWINIRWYLDVSGLKRSTAYLINGVVIFFSWLVARILLFGYMFYHVYLHHDQVMQMHTAGFLLVFVVPVALAIMNLMWF...

XP_057812133.1
MGRSLRTVGTLKAYQNQAGVLVKNYVLADPYIPYTSIVLGMLTCKLAYDLCQLISTFYSRNYNALTKIQRMEWNNRGISTLHAVFISIMSLYFVFWSELFSDQNHSGLVTFRNSSISTFALGLSVGYFLSDLGMICWRYPSLGGPEYVLHHSISAIAVAYAMYMGEGQLYTFMVLISEITTPWINIRWYLDVSGLKRSTAYLINGVVIFFSWLVARILLFGYMFYHVYLHHDQVMQMHTAGFLLVFVVPVALAIMNLMWF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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