当前解析结果
SmilChr05G002559| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002559 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002559 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002559 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 28718629 - 28719871 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025754 |
|---|---|
| GeneID | 131025754 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025754 |
| 原始查询 | SmilChr05G002559 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025754 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811524.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811524.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057811524.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057811524.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811524.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:28718661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A2,B101,B13,B131,B22,B27,B35,B40,B45,B74,B75,B77,C16,C71 |
Chr5:28718687 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B9,C82 |
Chr5:28718882 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr5:28718936 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr5:28718950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 104 | A10,A14,A19,A21,A22,A23,A24,A3,A5,B10,B109,B110,B114,B117,B118,B121,B124,B125,B126,B13,B132,B135,B140,B15,B17,B20,B21,B25,B26,B28,B29,B32,B34,B40,B41,B42,B43,B47,B49,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B58,B64,B66,B71,B72,B73,B8,B80,B81,B83,B84,B87,B88,B90,B94,B95,B96,C11,C13,C14,C16,C18,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C29,C3,C31,C35,C38,C4,C40,C43,C44,C46,C48,C50,C51,C52,C55,C57,C58,C62,C69,C7,C71,C72,C76,C77,C83,C84,C85,D11,D2,D7,D8 |
Chr5:28719452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B41,B8,B83,B93,C22 |
Chr5:28719472 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,C82 |
Chr5:28719487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr5:28719542 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | B103,B11,B32,B41,B42,B43,B44,B8,B83,B93,C2,C22,C24,C47,C57,C77,D2 |
Chr5:28719592 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr5:28719612 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A2,B101,B13,B131,B22,B27,B35,B45,B74,B75,B77,C16,C71 |
Chr5:28719641 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C74,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。