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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002574`

染色体: Chr05 坐标: 28942701-28943300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002574`
名称	SmilChr05G002574
描述	uncharacterized SmilChr05G002574
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	28942701 - 28943300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025760`
GeneID	`131025760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025760`
原始查询	`SmilChr05G002574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=30.5; qcov=0.759; evalue=1.18e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811529.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811529.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811529.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811529.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:28942701`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A21,B101,B105,B12,B18,B26,B33,B51,B66,B72,C10,C16,C22,C30,C32,C37,D3,D6
`Chr5:28942760`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B101,B12,B26,B51,B66,B72,C10,C37,D6
`Chr5:28942761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B118,B131,B67,C23
`Chr5:28942782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:28942806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:28942824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:28942839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B12,B131,B55,C23
`Chr5:28942877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B65,C63
`Chr5:28942941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B12,B131,B55,C23
`Chr5:28942947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C33,C38,C78
`Chr5:28942958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B12,B131,B55,C23
`Chr5:28942980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811529.1

199 aa

100

199

RVT_3

PF13456 RVT_3 59-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811529.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	59	179	9.7e-24	84.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955546.1
ATGGAGTATTTGGTACTCGAGAAATATGCTCATTTTTCAGCAAAAGGAAATCTCCCACCTGGAGTGTTTGGTGATTGCAAATCAAGCGGTTGGAAGCCCCCTCTGCGTGCTAGTACCCAACATCCACAAGCGGTCACTGTTACTTGTGATAGAGAAGGACAGCGGAAGATTTCGTGTGATGTGGCGTGGAATGGAGGGAATGGGATTGGGATAGGTGTGGTGATGACAACGGAGGATGGTGGTGTGGTGGGATGCAGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025760
ATGGAGTATTTGGTACTCGAGAAATATGCTCATTTTTCAGCAAAAGGAAATCTCCCACCTGGAGTGTTTGGTGATTGCAAATCAAGCGGTTGGAAGCCCCCTCTGCGTGCTAGTACCCAACATCCACAAGCGGTCACTGTTACTTGTGATAGAGAAGGACAGCGGAAGATTTCGTGTGATGTGGCGTGGAATGGAGGGAATGGGATTGGGATAGGTGTGGTGATGACAACGGAGGATGGTGGTGTGGTGGGATGCAGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811529.1
MEYLVLEKYAHFSAKGNLPPGVFGDCKSSGWKPPLRASTQHPQAVTVTCDREGQRKISCDVAWNGGNGIGIGVVMTTEDGGVVGCRYGFIHGNFSMLEGEALALLEGMHLGRENGVEDVIFETDSQSLYWLLFKREEDLSYLGNMLRDINREMDSFSHAMLSWTPREGNIAADKLASFALCNFSSLSSALVLSFDVNIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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