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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002583`

染色体: Chr05 坐标: 29044329-29048250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002583`
名称	SmilChr05G002583
描述	probable ribose-5-phosphate isomerase 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29044329 - 29048250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026338`
GeneID	`131026338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026338`
原始查询	`SmilChr05G002583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ribose-5-phosphate isomerase 4, chloroplastic
产物	probable ribose-5-phosphate isomerase 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G44520` (AT5G44520) NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834479] identity=56.9; qcov=0.801; evalue=1.4e-85; confidence=high
Rice	`Os03g0781400` - identity=60.7; qcov=0.808; evalue=9.71e-90; confidence=high
GO	GO:0004751 (ribose-5-phosphate isomerase activity); GO:0009052 (pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch)
KEGG	smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06026 (Rib_5-P_isom_A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812175.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057812178.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057812175.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057812178.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29044803`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr5:29044803`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr5:29046450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D10
`Chr5:29046542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812175.1

304 aa

152

304

Rib_5-P_isom_A

PF06026 Rib_5-P_isom_A 93-261 aa

XP_057812176.1

292 aa

146

292

Rib_5-P_isom_A

PF06026 Rib_5-P_isom_A 93-277 aa

XP_057812177.1

269 aa

134

269

Rib_5-P_isom_A

PF06026 Rib_5-P_isom_A 119-226 aa

XP_057812178.1

261 aa

130

261

Rib_5-P_isom_A

PF06026 Rib_5-P_isom_A 50-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812175.1`	Pfam	`PF06026`	Rib_5-P_isom_A	Family	93	261	5.2e-31	108.3	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)
`XP_057812176.1`	Pfam	`PF06026`	Rib_5-P_isom_A	Family	93	277	6.1e-35	121.1	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)
`XP_057812177.1`	Pfam	`PF06026`	Rib_5-P_isom_A	Family	119	226	1.7e-18	67.5	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)
`XP_057812178.1`	Pfam	`PF06026`	Rib_5-P_isom_A	Family	50	218	3.4e-31	108.9	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956193.1
GGGCTTATGTCGCGGGCCTCGCGGCCATTGCAATCGTAAAAATTAAAATATGGACTTAAGTCTGTCCTGAAACACAGTTGAAAGCAGAGAAAATTTAAGGCGATAATGGCGTTATCATCATCTTCATCAATTCTTCCCTTCTCTAATTTCAGTGGCAACCCTAATTCCAGTAAACCAAGTAGAAGCAGTAATGCGCTATCAATGGTGGTTCGCTCGAGCTACTCTGACGACTCCGCACTTCTCCTCCAAGTTGCCAAATA...

XM_057956192.1
TGCAATCGTAAAAATTAAAATATGGACTTAAGTCTGTCCTGAAACACAGTTGAAAGCAGAGAAAATTTAAGGCGATAATGGCGTTATCATCATCTTCATCAATTCTTCCCTTCTCTAATTTCAGTGGCAACCCTAATTCCAGTAAACCAAGTAGAAGCAGTAATGCGCTATCAATGGTGGTTCGCTCGAGCTACTCTGACGACTCCGCACTTCTCCTCCAAGTTGCCAAATACACTGTTGATTCATTTGTGGAGAATGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131026338
ATGGCGTTATCATCATCTTCATCAATTCTTCCCTTCTCTAATTTCAGTGGCAACCCTAATTCCAGTAAACCAAGTAGAAGCAGTAATGCGCTATCAATGGTGGTTCGCTCGAGCTACTCTGACGACTCCGCACTTCTCCTCCAAGTTGCCAAATACACTGTTGATTCATTTGTGGAGAATGGAATGGTGATAGGGCTGGGTTCTGGTCGTGCTTCTGGCTACGCTATCCAGTATTTGGGGCGGCAAATTCGGTCCGGAGC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057812175.1
MALSSSSSILPFSNFSGNPNSSKPSRSSNALSMVVRSSYSDDSALLLQVAKYTVDSFVENGMVIGLGSGRASGYAIQYLGRQIRSGAVKHITGVATSVDSASEAAKAGVPLGQYRDSSKIDLAFDDADVMEEESLAAVIGRQKMQGGESIIQEKTILKTAGKLVLIVTAKQYQGAVEGSIPVLIESVNWLETAEEIDDLFLGDAEVWRRSSIGHAGPLGGDFPLVTKEGHNVVDVIFTSPIQNLAEVGDSLDQVAGVVEH...

XP_057812176.1
MALSSSSSILPFSNFSGNPNSSKPSRSSNALSMVVRSSYSDDSALLLQVAKYTVDSFVENGMVIGLGSGRASGYAIQYLGRQIRSGAVKHITGVATSVDSASEAAKAGVPLGQYRDSSKIDLAFDDADVMEEESLAAVIGRQKMQGGESIIQEKTILKTAGKLVLIVTAKQYQGAVEGSIPVLIESVNWLETAEEIDDLFLGDAEVWRRSSIGHAGPLGGDFPLVTKEGHNVVDVIFTSPIQNLAEVGDSLDQVAGVVEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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