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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002588`

染色体: Chr05 坐标: 29080813-29081523 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002588`
名称	SmilChr05G002588
描述	uncharacterized SmilChr05G002588
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29080813 - 29081523 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025764`
GeneID	`131025764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025764`
原始查询	`SmilChr05G002588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=26.7; qcov=0.619; evalue=1.76e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=32.1; qcov=0.831; evalue=1.32e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811533.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811533.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811533.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811533.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29080843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A9
`Chr5:29080843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:29080849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:29080879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr5:29080886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A13,A2,A24,A25,A6,B125,B132,B134,B137,B139,B18,B24,B29,B3,B40,B5,B58,B6,B66,B73,B75,B80,B82,B85,B95,B96,B97,C1,C10,C12,C14,C17,C18,C27,C3,C35,C42,C59,C60,C61,C63,C73,C74,C83,C84,D10,D7
`Chr5:29080936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A2,A3
`Chr5:29080937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B22
`Chr5:29080994`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A11,A6,B103,B11,B115,B33,B7,B76,B77,B81,B9,B90,B92,B99,C1,C11,C19,C22,C26,C33,C44,C49,C5,C55,C57,C63,C69,C75
`Chr5:29081008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:29081072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A7,B35,B55,C23,D11
`Chr5:29081072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B35,B55,C23,D11
`Chr5:29081117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C32,C68,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811533.1

236 aa

118

236

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811533.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	151	1.8e-16	61.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955550.1
ATGGGGACTTGGGAGGAGACAGAATGGATTTGGGACCTAAAATGGAGAAGGACTCTCTTTGACTGGGAAGTGCCGATTCTTAATGAACTGTTATCTTCTATCTCTGCCATTGTCCCAACTGCAGGTACGATTGACGGCTGGAGATGGACGGCATCTAAGGATGGCAGATTTTCTACCAGCTCCGCTTACGCCTGGATCAAAGAAAGTAGGTCACGTGAAGTGACGAGATCTTCCAGTAAACAAAAATCAGCCTTGGCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025764
ATGGGGACTTGGGAGGAGACAGAATGGATTTGGGACCTAAAATGGAGAAGGACTCTCTTTGACTGGGAAGTGCCGATTCTTAATGAACTGTTATCTTCTATCTCTGCCATTGTCCCAACTGCAGGTACGATTGACGGCTGGAGATGGACGGCATCTAAGGATGGCAGATTTTCTACCAGCTCCGCTTACGCCTGGATCAAAGAAAGTAGGTCACGTGAAGTGACGAGATCTTCCAGTAAACAAAAATCAGCCTTGGCCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811533.1
MGTWEETEWIWDLKWRRTLFDWEVPILNELLSSISAIVPTAGTIDGWRWTASKDGRFSTSSAYAWIKESRSREVTRSSSKQKSALAWKICAPQKVRVSAWRILRNRLPSCDNLRKRNIPVGEEEIMCNACCQEVESANHVFLTCPKTDMLWSEIQRWTGFLSARPNSIEGHFDVFTQMGKGKKSRRFLSALWACTTWLIWKGRNESRFEGKNWDVKKLCGEIKARMWSWNRIFNFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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