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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002591`

染色体: Chr05 坐标: 29110766-29115636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002591`
名称	SmilChr05G002591
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29110766 - 29115636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026342`
GeneID	`131026342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026342`
原始查询	`SmilChr05G002591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=30.4; qcov=0.877; evalue=1.09e-26; confidence=low
Rice	`Os05g0583100` - identity=34.6; qcov=0.894; evalue=4.91e-35; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF14372 (hAT-like_RNase-H)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812182.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812182.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812182.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812182.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29112592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:29112602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C16,C36,C71,C8,D7
`Chr5:29112652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:29112654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B46,B69,C29
`Chr5:29112655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B46,B69,C29
`Chr5:29112679`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr5:29112679`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr5:29112730`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	50	A14,A19,A9,B101,B103,B105,B106,B110,B120,B126,B140,B16,B20,B26,B29,B31,B38,B4,B42,B46,B47,B52,B53,B55,B57,B61,B69,B7,B83,B89,B97,C12,C18,C2,C24,C29,C32,C34,C46,C51,C53,C56,C57,C6,C67,C7,C71,C76,C87,D8
`Chr5:29112793`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A1,B100,B47,B55,C17,C67,C74,C9,D3
`Chr5:29112795`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,B100,B47,B55,C17,C67,C74,C9,D3
`Chr5:29112814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:29112865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B17,B40,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812182.1

236 aa

118

236

hAT-like_RNase-H

Dimer_Tnp_hAT

PF14372 hAT-like_RNase-H 1-69 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 131-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812182.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	1	69	5.1e-18	65.8	hAT-like transposase, RNase-H fold
`XP_057812182.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	131	214	2.2e-29	101.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956199.1
TAATATGAAGGTTTCTGTAAATTTTCAGACCAATCCAATATGTTTTGCTATTTTTCCTTGAATTTAATAAGATGCTCGCAGAAATAGTTTAACTATGATGAACTTTCTGTTTTTCTATTATATTTGCGCATTGTTTGTTCTTTCCTTGAAGATTTTCATGAGATCACTGAACTCATCTCAGGTATTAATATATTTACTTTGCACTCATAATATATTGTGTAATTACTAATGTCAATTATATCATCACATTTAATGCAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026342
ATGAAAAAAATGCTTGAAAAGATGAAGTTGAAGTTTGATAAGTATTGGGGATCTTGTAATTTATTGATTTCTATAGCGGCTGTTTTAGACCCTAGAAACAAAATGAAGTATATTGAGTGGTGTGCTGACAATTGCTATTCTGGAGTGGAAGGGATTGAACTTAAAGTAACAGTTTTTGAGACATTGCGAAACTTGTATGCTGAATATGTAGAGGCTTATAGAGTTAGTACTAGTACTACTAATATTGTGAGAAATGCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812182.1
MKKMLEKMKLKFDKYWGSCNLLISIAAVLDPRNKMKYIEWCADNCYSGVEGIELKVTVFETLRNLYAEYVEAYRVSTSTTNIVRNASDAQTGSSSNVSGVSSVKSGTSRSQSKYESFRKTVTSVDQMKSDFDLYFEEAVEEWNEPTQFDAIGWWKMHKMKYKILSKMACDVLSIPITTVASESAFSAGGRVIDPHRASLGVDIVQMLLCAEDWLRARYEIKGKAKDKENTKEITFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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