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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002604`

染色体: Chr05 坐标: 29235764-29239104 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002604`
名称	SmilChr05G002604
描述	probable choline kinase 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29235764 - 29239104 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026357`
GeneID	`131026357`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026357`
原始查询	`SmilChr05G002604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable choline kinase 2
产物	probable choline kinase 2
Arabidopsis	`AT1G74320` (AT1G74320) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843772] identity=68; qcov=0.823; evalue=3.4e-178; confidence=high
Rice	`Os01g0717000` (P0683B11.20-2) - identity=63.6; qcov=0.828; evalue=9.67e-164; confidence=high
GO	GO:0004103 (choline kinase activity); GO:0004305 (ethanolamine kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006646 (phosphatidylethanolamine biosynthetic process); GO:0006656 (phosphatidylcholine biosynthetic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01633 (Choline_kinase); PF01636 (APH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026357

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812206.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812206.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812206.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812206.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29236280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:29236320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:29236727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D1
`Chr5:29236766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,B140,C33
`Chr5:29237817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:29237873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C9
`Chr5:29237897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:29238751`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr5:29238751`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr5:29238865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C22,C47,C6
`Chr5:29238921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812206.1

418 aa

209

418

Choline_kinase

APH

PF01633 Choline_kinase 106-403 aa PF01636 APH 195-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812206.1`	Pfam	`PF01633`	Choline_kinase	Domain	106	403	1.5e-98	330.6	Choline/ethanolamine kinase
`XP_057812206.1`	Pfam	`PF01636`	APH	Domain	195	315	1.6e-11	45.1	Phosphotransferase enzyme family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956223.1
GATTTTGATAAACAAATGTAACATGGTCCGTGATAGTAGAAGAAATGCACAAAGTTAAGTCGAAATAATGCAGAGGTTGAGATGGGCAGATCACGTGCCGTCCACGTGGACGAAACGGTTCCCGGTCAAGCACCGCCAAGTGGCAACGGTAGCATTGATCCCGATTCCGAAGGCCTACCTCTCCTCTTTCCCCTTGGACAGGCGGATTTCTCGATTTCTCCCAACTGTTCAAATCTCTCCGAATTCATCCATTTCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026357
ATGCAGAGGTTGAGATGGGCAGATCACGTGCCGTCCACGTGGACGAAACGGTTCCCGGTCAAGCACCGCCAAGTGGCAACGGTAGCATTGATCCCGATTCCGAAGGCCTACCTCTCCTCTTTCCCCTTGGACAGGCGGATTTCTCGATTTCTCCCAACTGTTCAAATCTCTCCGAATTCATCCATTTCTCCTCCAATTCAATCTCCCATGGGATCTCCCGACAAATCCGCTCGCATTCCCGATGACGCCAGGAAGATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812206.1
MQRLRWADHVPSTWTKRFPVKHRQVATVALIPIPKAYLSSFPLDRRISRFLPTVQISPNSSISPPIQSPMGSPDKSARIPDDARKILVRMASEWRDIVDPEALQVVPLKGAMTNEVYQIKWIRNSSADEPLPRSKKVLVRIYGAGVDVFFDRENEIRTFEFMSKQGQGPRLLGRFANGRVEEFIHARTLVAADLRDPEISGIIASKMKEFHCLDMPGSKKIVLWDRLRKWVKEANRVSSPQEAKKFRLDVLEAEISALEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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