Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002610`

染色体: Chr05 坐标: 29358697-29365128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002610`
名称	SmilChr05G002610
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29358697 - 29365128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026360`
GeneID	`131026360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026360`
原始查询	`SmilChr05G002610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2
Arabidopsis	`AT4G20790` (AT4G20790) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827827] identity=46.9; qcov=0.973; evalue=8.58e-154; confidence=high
Rice	`Os09g0423200` - identity=26.7; qcov=0.916; evalue=6.5e-24; confidence=low
GO	GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057812210.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812210.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29363212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:29363269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:29363321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C22,C47,C6
`Chr5:29363618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:29363624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:29363702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C86
`Chr5:29363713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B93
`Chr5:29363786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:29363792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B117,B140,B25,B46
`Chr5:29363831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:29363861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:29363903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812210.1

511 aa

256

511

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 270-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812210.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	270	396	9.6e-12	45.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956227.1
TTCTGTTGCATCCAGGAACAGTAGATACAGATTTATCAAGACCGTTTCAGAGGAATGTTGCAGAAGGCAAGCTCTTCACCAAAGAGTTTTCTGTCCAGAAATTGCTGGGCATCATTAACAGTGTGAAAGCATCTGATAACGCATGGCCTCCATCTCTGCAAAAACCGTTGCTTTCTTCCCAATCTTGATTGCAATCTCAATTCCCACGACGTTCACGGCAACGGTGGTGGAAGACCTGAACAACCTGCAGCCTCCGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026360
ATGGCCTCCATCTCTGCAAAAACCGTTGCTTTCTTCCCAATCTTGATTGCAATCTCAATTCCCACGACGTTCACGGCAACGGTGGTGGAAGACCTGAACAACCTGCAGCCTCCGCCGGATTTCAACGCCACCATCACAAACAACTGCCGAAACAACCCTTCTCTCCGATACTGCAACTCCACCCCTTTCAATCTTGTCCAGATTTTCAAGTCCACCATCGTGGCGAGCCATCTGTGCAACATCTCCAACAATCCCAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812210.1
MASISAKTVAFFPILIAISIPTTFTATVVEDLNNLQPPPDFNATITNNCRNNPSLRYCNSTPFNLVQIFKSTIVASHLCNISNNPNCVESFPKIDLRGRPKIAPLYLSLDFFWRYCPLTILSIDLSNNSLQGSFPQDVFYCSQIRSLDLSLNRLSGDVPLHKLSSLQNLTSLNLSYNAFSECRISETRFFDRFNSSSFLHSGLLPDHRELRLRMVAFLVGFPAAVIAAVVCFLWCCFWRGGGEGGHRFKAWVLEEASKGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器