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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002630`

染色体: Chr05 坐标: 29663782-29665604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002630`
名称	SmilChr05G002630
描述	berberine bridge enzyme-like 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29663782 - 29665604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026385`
GeneID	`131026385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026385`
原始查询	`SmilChr05G002630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 18
产物	berberine bridge enzyme-like 18
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=47.6; qcov=1; evalue=8.37e-168; confidence=high
Rice	`Os06g0548800` - identity=45.8; qcov=0.959; evalue=4.62e-138; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057812235.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812235.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812235.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812235.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29664415`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	72	A13,A14,A4,A5,A7,B1,B103,B106,B112,B114,B119,B12,B122,B124,B125,B129,B13,B133,B137,B139,B15,B17,B18,B23,B24,B25,B26,B29,B31,B42,B44,B47,B55,B6,B65,B66,B75,B78,B83,B84,B85,C13,C15,C16,C17,C19,C26,C27,C30,C32,C4,C40,C42,C45,C49,C52,C56,C6,C62,C63,C65,C71,C73,C75,C77,C80,C82,C83,D4,D5,D7,D8
`Chr5:29664418`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	72	A13,A14,A4,A5,A7,B1,B103,B106,B112,B114,B119,B12,B122,B124,B125,B129,B13,B133,B137,B139,B15,B17,B18,B23,B24,B25,B26,B29,B31,B42,B44,B47,B55,B6,B65,B66,B75,B78,B83,B84,B85,C13,C15,C16,C17,C19,C26,C27,C30,C32,C4,C40,C42,C45,C49,C52,C56,C6,C62,C63,C65,C71,C73,C75,C77,C80,C82,C83,D4,D5,D7,D8
`Chr5:29664458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C6
`Chr5:29664474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C6
`Chr5:29664512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr5:29664693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B119,B123,B134,B87
`Chr5:29664754`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B65
`Chr5:29664754`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B65
`Chr5:29664890`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A23,B133,B17,B30,B44,B7,B73,C17,D9
`Chr5:29664893`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A23,B133,B17,B30,B44,B7,B73,C17,D9
`Chr5:29664920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B121,B32,C77,C87
`Chr5:29665423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812235.1

531 aa

266

531

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 78-215 aa PF08031 BBE 470-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812235.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	78	215	1.4e-24	87.1	FAD binding domain
`XP_057812235.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	470	527	3.8e-20	72.3	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956252.1
AACTTCTATAAATAGAAGGCTAACAAACAAGACTAACATCAACAGAACAAATGGCGTCTCCTCATACTCTCACATTCCTCTTCTTAATTTTCACAAACCTCTTACTCTTCGGAGCTTCTTCATCTATAGATCATGGCTACGACGATTTTCTCGAATGCTTAACCGATCAATTCCAACGCTCAAACTCAGCTACTGATATAATCTATACCCCTCAAAATGCAACCTATGCATCTCTTTTACTATCACAAAATCTCCGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026385
ATGGCGTCTCCTCATACTCTCACATTCCTCTTCTTAATTTTCACAAACCTCTTACTCTTCGGAGCTTCTTCATCTATAGATCATGGCTACGACGATTTTCTCGAATGCTTAACCGATCAATTCCAACGCTCAAACTCAGCTACTGATATAATCTATACCCCTCAAAATGCAACCTATGCATCTCTTTTACTATCACAAAATCTCCGGCCAGCTTCCAGCTTGTTGGAGAGACCCGACCTCATCGTCACGCCCTTCCACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812235.1
MASPHTLTFLFLIFTNLLLFGASSSIDHGYDDFLECLTDQFQRSNSATDIIYTPQNATYASLLLSQNLRPASSLLERPDLIVTPFHVSEIQAAIYCSRMLGLQIRVKSGGHDYEGLSYTSAATPFVIVDMRNFRSVTIDDKEKTARVQVGATLGQLYYTISRKSRTLAFPAGVCPTVGVGGHFSGGGYGMISRKHSIASDHIVDAILINADGKILDRRSMGEDLFWAIRGGGGTSFGIVLEFKVTLVTVPETVTVFNVTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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