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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002636`

染色体: Chr05 坐标: 29766274-29768252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002636`
名称	SmilChr05G002636
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29766274 - 29768252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026381`
GeneID	`131026381`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026381`
原始查询	`SmilChr05G002636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
产物	tetrahydroberberine oxidase-like
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=49; qcov=0.98; evalue=5.96e-180; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=46.9; qcov=1.01; evalue=1.1e-161; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026381

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057812232.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812232.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812232.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812232.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812232.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29766441`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A13,B124,B130,B135,B24,B3,B76,B78,B93,C13,C33,C35,C4,C45,C46,C50,C56,C60,C65,C85,D3,D7
`Chr5:29766445`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr5:29766445`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr5:29766451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B134
`Chr5:29766683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:29766722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29766814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr5:29766816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C35,C75
`Chr5:29766826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B122,B71
`Chr5:29766905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr5:29766944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B134
`Chr5:29767242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812232.1

537 aa

268

537

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 81-217 aa PF08031 BBE 476-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812232.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	81	217	6.6e-24	84.9	FAD binding domain
`XP_057812232.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	476	534	1.6e-20	73.5	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956249.1
TCCACGAACAATACTTCAAATCTGACGTTTCGAATTCAAACATTCGCATACTTTTCCTATAAGTAGATTAATGATGGAGTCTCATTTAAACACAAAATCATCGTCATCATTCAATCATGAAGAGTCCTAACATTTCCACACTCTCATTCATTCTTGTTCTTCTTCTCATCTCTTTGTCCTCTCCCGCAGCTTCTGCTGCCTATAAGCACCGAGATTTTCTTGAATGTCTAACCCAACAATTCAAGAACTATTCTTCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026381
ATGAAGAGTCCTAACATTTCCACACTCTCATTCATTCTTGTTCTTCTTCTCATCTCTTTGTCCTCTCCCGCAGCTTCTGCTGCCTATAAGCACCGAGATTTTCTTGAATGTCTAACCCAACAATTCAAGAACTATTCTTCGATTTCAAGCAACGTTTACACCCCCACAAACACATCATACTCTTCCGTTCTTCGATTTTCCATCCAAAGTTTAAGATTCACCTCAGATTCTACTCCAAAACCGCTCGTAATTTTACAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812232.1
MKSPNISTLSFILVLLLISLSSPAASAAYKHRDFLECLTQQFKNYSSISSNVYTPTNTSYSSVLRFSIQSLRFTSDSTPKPLVILQPEYESQIPPIICCAKSSGLQIRTRSGGHDYEGLSYVAQVPFVILDLINLSEIKVDAAEKTAWVGSGSTTGSVYYRVAEKSPVLGFPAGSCTTIGIGGHFSGGGYGTLMRKYGLAADQVIDARIVDVNGRILDRESMGEELFWAIRGGGGASFGVILAWKVQLVDVPEKVTVFSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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