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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002647`

染色体: Chr05 坐标: 29904667-29906354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002647`
名称	SmilChr05G002647
描述	berberine bridge enzyme-like 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29904667 - 29906354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026392`
GeneID	`131026392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026392`
原始查询	`SmilChr05G002647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 18
产物	berberine bridge enzyme-like 18
Arabidopsis	`AT4G20820` (AT4G20820) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827830] identity=53.1; qcov=0.97; evalue=8.67e-112; confidence=high
Rice	`Os06g0549900` - identity=49.5; qcov=0.919; evalue=2.59e-93; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057812245.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057812245.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812245.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812245.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29904747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29904774`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	66	A11,A13,A16,A20,A22,A8,B118,B12,B120,B124,B126,B128,B130,B135,B136,B14,B19,B23,B27,B34,B38,B39,B44,B5,B55,B56,B67,B70,B76,B78,B79,B85,B86,B93,B96,C13,C15,C16,C18,C2,C20,C27,C29,C33,C38,C39,C4,C45,C46,C48,C50,C52,C53,C54,C59,C60,C7,C72,C74,C77,C79,C81,C85,D2,D3,D7
`Chr5:29904817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:29904955`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A13,C20,C46
`Chr5:29904955`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A13,C20,C46
`Chr5:29904958`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A13,C20,C46
`Chr5:29904958`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A13,C20,C46
`Chr5:29904961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:29905034`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	104	A1,A10,A14,A19,A2,A4,A5,A9,B1,B10,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B121,B122,B123,B132,B133,B137,B138,B139,B16,B17,B18,B20,B22,B26,B31,B34,B36,B37,B38,B4,B40,B41,B42,B45,B48,B50,B54,B59,B6,B60,B63,B64,B72,B76,B77,B78,B81,B82,B83,B89,B9,B90,B94,B97,C10,C12,C15,C19,C21,C22,C25,C30,C31,C34,C35,C39,C40,C41,C47,C49,C5,C51,C54,C56,C58,C61,C62,C63,C64,C65,C68,C7,C72,C76,C77,C78,C80,C83,C85,D10,D4,D5,D6,D8
`Chr5:29905163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C75
`Chr5:29905255`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr5:29905255`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812245.1

332 aa

166

332

FAD_binding_4

PF01565 FAD_binding_4 52-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812245.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	52	188	1.9e-25	89.9	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956262.1
GCTCCGAGCATTTTATCTCTCACTTTCATACTTCTTGCCATCATTTCGTGCTCCCAAGCATCATCTTATGCTGATAATTTCCTTCAATGTTTGCACAAAGAATTCCACAAACTACTCTTCCATTTCCAACAACATCTACGCCCCAATCAACTCTTCTTATTCATCTATCTTGCAATTAACCATCCAGAATCCGAGATTCGCCTCAGATCCTACTTCATCACCGCTTATCATCATCACCCCACAACACGAATCACAAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026392
ATGCTGATAATTTCCTTCAATGTTTGCACAAAGAATTCCACAAACTACTCTTCCATTTCCAACAACATCTACGCCCCAATCAACTCTTCTTATTCATCTATCTTGCAATTAACCATCCAGAATCCGAGATTCGCCTCAGATCCTACTTCATCACCGCTTATCATCATCACCCCACAACACGAATCACAAATCCCACCTTTAATCCACTGCGCCCAAGAGACTAAGCTGCAAATTAGAACTCGAAGTGGTGGACATGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812245.1
MLIISFNVCTKNSTNYSSISNNIYAPINSSYSSILQLTIQNPRFASDPTSSPLIIITPQHESQIPPLIHCAQETKLQIRTRSGGHDFEGLSYRAQLPFVIIDLINLSDTTVDVDRKTAWVGVGATIGSLYYTIAERSPILGFPAGLCPTVGLGGYISGGGYGTMMRKYGLAADNVIDAKIVDAKGRILDRKSMGEDLFWAIRGGGGGSFCVILAWKVQLVDVPKKVTVFRVSRTLEQNATQIIHRWQYTAPKLNKDLFIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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