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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002648`

染色体: Chr05 坐标: 29943498-29947306 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002648`
名称	SmilChr05G002648
描述	uncharacterized SmilChr05G002648
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29943498 - 29947306 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026374`
GeneID	`131026374`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026374`
原始查询	`SmilChr05G002648`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026374

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812224.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057812224.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057812224.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057812224.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057812224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29945222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C3
`Chr5:29945328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr5:29946085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:29946086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:29946103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:29946437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:29946464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C45
`Chr5:29946508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B59,B85,C67
`Chr5:29946545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B98,C45
`Chr5:29946601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:29946620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B117,B74,B85,B95
`Chr5:29946644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812224.1

750 aa

375

750

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 489-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812224.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	489	585	1.5e-06	29.6	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956241.1
TTTTTCCCATAGTTTAGATAGATAGAAACATTCTAGATACTTGTGGATTCCGCTAGATCGTTGATTTCATTGGATCGATTGTCGTCGTAGCTTGAAGAGAAAGCTAGTGCCTTACTTTGACAACATTCATCGACCTCGTGAGGTCCTTTCAAGCCTGGAGAAGGAGTCCGAGTCCAGTTCGAGAAGCCTTGTGGAATCACAGTTTAGTGAGGAAAACTGTGAAGAGAGAATTGCTTCCAATCCCATTCTGGAAGCCGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026374
ATGGCGGAGCAGAATGTCCAGTACATGGGAGATTTTTCCAGGCCAGTTATTGGGACCACTAGCACTTCTGCGATAGTGTTTCCCACGGCGGTCCGGAATTATAATCTGAAGCCCAACGACTCAAACCTGCTGCCGCTCTTTCACGGGATGCCCAGTGAGGACGCCTTGCAGTTCATCCGTGATTTCTGCACCCAAGTGCAGACCTTCCCACTGCTGGAGCTCACCGAGGATCAGTTGAGACTCAAGTGCTTACCTTATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812224.1
MAEQNVQYMGDFSRPVIGTTSTSAIVFPTAVRNYNLKPNDSNLLPLFHGMPSEDALQFIRDFCTQVQTFPLLELTEDQLRLKCLPYALKDRARTWLLSLPPNSITTWGEASEKFMLKYYPNHKTQEIRSQIMNFMQGADEPFHEAWERFQELLRQCPQHQLPPVMLMQFFYDGLIQTAQFMVDSTAGGNIARKTADELKGIFETLAASSQQKSVRGRRVEANAVAPNNELQKQVADLMRQVQHLTMNQVKAPPVHAPPAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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