当前解析结果
SmilChr05G002650| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002650 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002650 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002650 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 29980698 - 29983384 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026400 |
|---|---|
| GeneID | 131026400 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026400 |
| 原始查询 | SmilChr05G002650 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026400 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057812260.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057812260.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812260.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812260.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057812260.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:29982222 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A22,B101,B106,B108,B109,B120,B121,B140,B15,B18,B30,B36,B50,C17,C19,C78,C82 |
Chr5:29982234 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A15,A4,B133,B48,B75,B90,C12,C21,C22,C24,C37,C9,D11,D8 |
Chr5:29982244 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 91 | A1,A15,A2,A20,A22,A23,A4,A7,A9,B1,B101,B102,B106,B108,B109,B113,B117,B118,B120,B121,B123,B126,B127,B129,B136,B138,B140,B15,B18,B2,B22,B26,B35,B36,B4,B41,B45,B48,B5,B50,B51,B57,B60,B67,B68,B70,B72,B73,B75,B76,B82,B83,B85,B86,B9,B99,C14,C15,C17,C19,C2,C20,C23,C24,C27,C29,C34,C41,C42,C43,C49,C51,C52,C57,C58,C59,C60,C64,C7,C71,C75,C76,C78,C8,C82,C84,C9,D10,D6,D7,D9 |
Chr5:29982258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr5:29982262 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B14,B15,B83,B9,C51,C59 |
Chr5:29982266 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B14,B15,B83,B9,C51,C59 |
Chr5:29982285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 36 | A23,B101,B105,B117,B129,B131,B132,B134,B20,B28,B51,B57,B62,B63,B66,B69,B74,B82,B91,B97,C15,C33,C35,C4,C40,C50,C52,C56,C61,C63,C67,C75,C82,C9,D3,D5 |
Chr5:29982315 |
CAG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 51 | A10,A2,A24,A3,A6,A9,B100,B107,B108,B111,B12,B124,B131,B135,B136,B18,B2,B23,B33,B36,B37,B38,B41,B42,B43,B5,B59,B65,B7,B70,B80,B81,B97,B99,C14,C20,C21,C33,C38,C40,C41,C6,C64,C71,C75,C77,C79,C83,C87,D10,D3 |
Chr5:29982318 |
T |
TAC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A10,A24,A3,A6,A9,B100,B107,B108,B111,B12,B124,B131,B135,B18,B2,B23,B33,B36,B37,B38,B41,B42,B43,B5,B59,B65,B7,B80,B81,B97,B99,C14,C20,C21,C33,C38,C40,C41,C6,C64,C71,C75,C77,C79,C83,C87,D10,D3 |
Chr5:29982319 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A2,B70 |
Chr5:29982319 |
A |
ACT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | A2,B70 |
Chr5:29982519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,C52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。