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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002656`

染色体: Chr05 坐标: 30063418-30065256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002656`
名称	SmilChr05G002656
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30063418 - 30065256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026384`
GeneID	`131026384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026384`
原始查询	`SmilChr05G002656`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetrahydroberberine oxidase-like
产物	tetrahydroberberine oxidase-like
Arabidopsis	`AT5G44400` (AT5G44400) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834466] identity=47.6; qcov=0.993; evalue=1.14e-176; confidence=high
Rice	`Os06g0548100` - identity=45.9; qcov=0.994; evalue=7.5e-155; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057812234.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812234.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812234.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812234.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30063553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C75
`Chr5:30063608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:30063678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A18,B62
`Chr5:30063679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C47,C6
`Chr5:30063802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:30063825`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	183	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A2,A21,A23,A25,A4,A6,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B2,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B75,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C19,C2,C21,C22,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C40,C41,C43,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C84,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr5:30063919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:30063926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B32,B7,C36
`Chr5:30064046`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C35,C52
`Chr5:30064046`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C35,C52
`Chr5:30064049`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C35,C52
`Chr5:30064049`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C35,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812234.1

535 aa

268

535

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 76-212 aa PF08031 BBE 470-528 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812234.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	76	212	1.6e-25	90.2	FAD binding domain
`XP_057812234.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	470	528	2.5e-21	76.1	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956251.1
CTAGCTTCATTCCACAAAGAAATCATCTCTCAACTATGAAGACTCCAAGCATTTTATCTCTCACTTTCATACTTCTTGCCATCATTTCGTGCTCTCGAGCATCATCTTGTGCTGATGATTTCCTTCAATGTTTGCGCAAACAATTCAACAACTACTCTTCCATTTCCAACAACATCTACACCCCAATCAACTCTTCTTATTCATCTATCTTGCAATTAACCATCCAGAATCCGAGATTCGCCTCAGATCCTACTTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026384
ATGAAGACTCCAAGCATTTTATCTCTCACTTTCATACTTCTTGCCATCATTTCGTGCTCTCGAGCATCATCTTGTGCTGATGATTTCCTTCAATGTTTGCGCAAACAATTCAACAACTACTCTTCCATTTCCAACAACATCTACACCCCAATCAACTCTTCTTATTCATCTATCTTGCAATTAACCATCCAGAATCCGAGATTCGCCTCAGATCCTACTTCATCACCGCTTATCATCATCACCCCACAACACGAATCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812234.1
MKTPSILSLTFILLAIISCSRASSCADDFLQCLRKQFNNYSSISNNIYTPINSSYSSILQLTIQNPRFASDPTSSPLIIITPQHESQIPPLIHCAQETKLQIRTRSGGHDFEGLSYRAQLPFVIIDLINLSDITVDVDRKTAWVGVGATIGSLYYTIAERSPILGFPAGLCPTVGLGGYISGGGYGTMMRKYGLAADNVIDAKIVDAKGRILDRKSMGEDLFWAIRGGGGASFCVILAWKVQLVDVPKRVTVFRVSRTLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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