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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002660`

染色体: Chr05 坐标: 30109115-30111775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002660`
名称	SmilChr05G002660
描述	uncharacterized SmilChr05G002660
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30109115 - 30111775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026390`
GeneID	`131026390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026390`
原始查询	`SmilChr05G002660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0482500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0482500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03780` (TRFL10) TRF-like 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831726] identity=41.7; qcov=0.286; evalue=2e-12; confidence=weak
Rice	`Os11g0482500` - identity=25.2; qcov=1.09; evalue=4.18e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812244.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812244.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812244.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812244.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30109545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:30110167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B18,C67
`Chr5:30110323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:30110336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:30110429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812244.1

378 aa

189

378

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 323-373 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 325-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812244.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	323	373	8e-07	29.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057812244.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	325	374	3.4e-06	27.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956261.1
GGACGACTCTGATCCATTATTCATATCCAATGGCTCATCTTCTTTGTGTCGTTTGGCTTCCCTCTTTGTTTCTAAAACACCCATTATTATTTCCTTAAAGATCCCTCTTTTAACCTTCGCTAATTCTCCTTGTCCCTCCCTCGTCTGCATCTTCATTTACAGAGTTTGGGGAGACAGCAGCATATTCAAGAGAAGAGCTGTTATCTTGTAAGGTGTTGTGAGATCATATTGGGGTGAAGGAGCTGGTGTTTCTGTGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026390
ATGGATTGGTCAGAAAATAATTGGTGCATAAAATGTGATAAAGGTGGGAATGTGCTGCTTTGCAGTGAAAACGGTTGTCCTTTAGCTGTTCATGAAGGATGTTTGGGGTGTCCAGCTAGAACAGATGATGCAGGCCGCTTCTATTGCCCCTATTGTTTGTACAAGCAAGCTGTTGCTGAGTCGCGTAAAGCAAGAGAATATGCTTTGTTAAGGAAGAAAGCTTTGTTGATCTTTATGGACGGCAGTGAAAAAGATACAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812244.1
MDWSENNWCIKCDKGGNVLLCSENGCPLAVHEGCLGCPARTDDAGRFYCPYCLYKQAVAESRKAREYALLRKKALLIFMDGSEKDTGENKACEDNGHDQSKTSGYVNDASCDGGKSKSNNDGIIDQPFPLGEEEKICIAEKDYDTTAGSKGEDHSLMMNVENGNRTVEEKQTQKDECEPSVEEKNVQEEEREASVEEVNVEEEEHEASVEEEKIQEEDCETSSDSTNQDPSLTVPARPKRGSKRSKPVDKESEAVPVQSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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