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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002681`

染色体: Chr05 坐标: 30294316-30295011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002681`
名称	SmilChr05G002681
描述	uncharacterized SmilChr05G002681
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30294316 - 30295011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025790`
GeneID	`131025790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025790`
原始查询	`SmilChr05G002681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=25.9; qcov=0.567; evalue=1.14e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.2; qcov=0.818; evalue=5.83e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811561.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811561.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811561.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811561.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30294386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A15,A16,A2,A21,A22,A6,A8,B1,B103,B108,B111,B113,B126,B131,B135,B136,B139,B14,B15,B18,B27,B31,B5,B52,B54,B58,B65,B67,B7,B70,B78,B89,C26,C3,C32,C39,C48,C5,C50,C55,C64,C68,C82,C83,C86,D7
`Chr5:30294461`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B110,B17,B32,B34,B41,B61,B73,B95,B99,C4,C60
`Chr5:30294480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:30294485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A23
`Chr5:30294491`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr5:30294491`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr5:30294509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B14,B2,C75
`Chr5:30294539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A24,B28,B46,C83,D3
`Chr5:30294539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B28,B46,C83,D3
`Chr5:30294551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C29,D10
`Chr5:30294557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:30294579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811561.1

231 aa

116

231

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811561.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	126	3.4e-18	66.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955578.1
ATGACTGAAGCTTTAAAATTATTTATATTCGGATGTTCCCCTCGCTGTGGTCTGGAAGATGGCTGGGATTGGAAGGCGATGAAGGACGGAAGGTTTTCAACAAAATCTGCTTATGAAGCTCTTGTGGCCACTAGAAGTGATTCATCTGCTGTGACTTACCAAAACGAGACGTCTGGAAAAATTTGGGACGCTCCGGCTCCTTTCAAGGCGAGAGTTACTGCATGGAGATGCCTTCGCAACAGATTGGCAACTTGTGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025790
ATGACTGAAGCTTTAAAATTATTTATATTCGGATGTTCCCCTCGCTGTGGTCTGGAAGATGGCTGGGATTGGAAGGCGATGAAGGACGGAAGGTTTTCAACAAAATCTGCTTATGAAGCTCTTGTGGCCACTAGAAGTGATTCATCTGCTGTGACTTACCAAAACGAGACGTCTGGAAAAATTTGGGACGCTCCGGCTCCTTTCAAGGCGAGAGTTACTGCATGGAGATGCCTTCGCAACAGATTGGCAACTTGTGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811561.1
MTEALKLFIFGCSPRCGLEDGWDWKAMKDGRFSTKSAYEALVATRSDSSAVTYQNETSGKIWDAPAPFKARVTAWRCLRNRLATCDNLIKRKVALQVEDSWCNSCAAQEETAAHLFLHCPKTEQVWDLIQQWVGQRTARPQGILQHFFIFVHGGRGKSSKKFLKALWICTVWLIWKSLNESRFEGKVCDAQKLVLEIKGRMWSWNHSFGTTVSDACFSKWCSREFTTSFLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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