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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002699`

染色体: Chr05 坐标: 30968776-30970811 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002699`
名称	SmilChr05G002699
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30968776 - 30970811 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026438`
GeneID	`131026438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026438`
原始查询	`SmilChr05G002699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=49.2; qcov=0.959; evalue=7.43e-168; confidence=high
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity); GO:0046148 (pigment biosynthetic process)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00950 (Isoquinoline alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812288.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057812288.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057812288.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30969246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:30969310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:30969400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:30969538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C35
`Chr5:30969630`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr5:30969630`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr5:30969631`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	B100,B14,B30,B36,B53,B59,B63,B66,B72,B76,B9,B90,B92,B97,C21,C33,C38,C54,C70,C78,C79,C84
`Chr5:30969670`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	B100,B14,B30,B36,B53,B59,B63,B66,B72,B76,B9,B90,B92,B97,C21,C33,C38,C54,C70,C78,C79,C84
`Chr5:30969685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:30969696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B35,C85
`Chr5:30969696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C85
`Chr5:30969745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C28,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812288.1

566 aa

283

566

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 155-361 aa PF12142 PPO1_DWL 369-420 aa PF12143 PPO1_KFDV 439-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812288.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	155	361	5.5e-38	132.2	Common central domain of tyrosinase
`XP_057812288.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	369	420	4.2e-23	81.5	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057812288.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	439	564	1.7e-45	155.0	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956305.1
ATAATGATTTTATTTAATATTTATATTTATTTATTTAACTATATTTATTCAATTTCAATACTCGCCGTACTGCTAAGATAAATAAAAAGAAGAAGAAAAAGAAAGATAATTTACGTTTGAATAGTAGTAAGGCAGCCAACGTTGAATATCGTAATTCTCACAAATTGCAATTTGGATGTGCAAATTGCCAATGCAATAATTATATCCCGGCCGATTCTATAAAATGTCCCACTTCATCGTCTACTCCATCCACGTATAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026438
ATGGCATTTCCTCCACTTTCCTCCTCCTCCCTCACCATCTCCTCGCGGCCGAAATTCTTTGGAGAGCTGCCTCATTTCTCCACCCGATCAACTCCGTGCCACCGGTTCACAATGTCGTGCAGAGCCGAGAATGGAGGCAAAGTTGACCGAAGAAATTTGCTACTCGGCATGGGAGGCCTCTGCGGCGCTACCAATCTCGTCAAAGCCGATGCACCACCAGCTCTGGCGGCTCCGATTTCAGCTCCTGATCTGGCCAAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812288.1
MAFPPLSSSSLTISSRPKFFGELPHFSTRSTPCHRFTMSCRAENGGKVDRRNLLLGMGGLCGATNLVKADAPPALAAPISAPDLAKCSRGTNLNTKQPLDVNCCPPFSDKIIDYKLPPVTKLRLRPAAHLVTKEYIAKYEKATELMKALPDDDPRSFMQQANVHCAYCNLTYEQTGDPDEKLQVHNSWLFYPWHRWYLYFYERILGKLIDDPTFALPYWNWDNPPGMPMPALFVNENSPLYNPKRNQAHLPPALMDLLYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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