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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002706`

染色体: Chr05 坐标: 31111003-31111644 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002706`
名称	SmilChr05G002706
描述	uncharacterized SmilChr05G002706
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31111003 - 31111644 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025795`
GeneID	`131025795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025795`
原始查询	`SmilChr05G002706`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.3; qcov=0.643; evalue=6.33e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=43.5; qcov=0.864; evalue=4.79e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811566.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811566.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811566.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811566.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31111031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	B110,B140,B21,B25,B47,B68,C18,C29,C31,C48,C56,C58,C64,C65,C66,C72,D2,D3
`Chr5:31111036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A4,A5,B1,B101,B102,B115,B121,B32,B48,B68,B7,B89,C26,C36,C60,C87
`Chr5:31111063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B77,C73,D6
`Chr5:31111110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A10,A14,A19,A23,A9,B106,B107,B119,B123,B124,B132,B133,B138,B139,B15,B2,B20,B24,B31,B4,B48,B53,B57,B58,B64,B71,B75,B81,B84,B88,B98,C1,C17,C19,C22,C27,C28,C34,C41,C5,C53,C57,C61,C64,C66,C80,C86,C9
`Chr5:31111169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:31111186`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,A9,B104,B119,B123,B134,B21,B87,C3
`Chr5:31111241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C86
`Chr5:31111248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:31111269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:31111278`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B10,B114,B17,B25
`Chr5:31111278`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B10,B114,B17,B25
`Chr5:31111281`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A1,A19,A6,B103,B113,B136,B15,B16,B23,B26,B29,B5,B6,B69,B74,B83,B95,C19,C32,C37,C39,C55,C56,C67,C68,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811566.1

213 aa

106

213

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 63-99 aa PF04827 Plant_tran 168-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811566.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	63	99	1.5e-13	51.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811566.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	168	213	5.8e-11	43.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955583.1
ATGTCATCATCATCATCTTCCCAATCTTCCTCCAACTCAAGCGGCGACGAGCAACGTGCTCACCAATTCTCCCAACTTGTGTCGCAATTTTATAAAATTTCTAACGATGTTGGTCCGCCGGAAAGCCCTCCTAGACTAAGAAGGCTAACGAAGAAACCTTGCATTCATCGGGATCGTGAAGCCGGAGCACGTCTCTATGAGGATTATTTTGTCCCCAATCCGGTCTGCACCGATTCCATGTTCTGGCGCTGTTTCCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025795
ATGTCATCATCATCATCTTCCCAATCTTCCTCCAACTCAAGCGGCGACGAGCAACGTGCTCACCAATTCTCCCAACTTGTGTCGCAATTTTATAAAATTTCTAACGATGTTGGTCCGCCGGAAAGCCCTCCTAGACTAAGAAGGCTAACGAAGAAACCTTGCATTCATCGGGATCGTGAAGCCGGAGCACGTCTCTATGAGGATTATTTTGTCCCCAATCCGGTCTGCACCGATTCCATGTTCTGGCGCTGTTTCCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811566.1
MSSSSSSQSSSNSSGDEQRAHQFSQLVSQFYKISNDVGPPESPPRLRRLTKKPCIHRDREAGARLYEDYFVPNPVCTDSMFWRCFRVRRPMLLRIVNTVLSDPYFQQRSDALGGSGFTLLQKCIIVIRQLANGGAANQYDEYMRIEETTSSECLSKFFRVIVQLFGPKYLRRPTFTNCQRLLALHKEKHRFLGMLESLYCMHWSWKNCPVKWQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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