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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002712`

染色体: Chr05 坐标: 31235920-31236411 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002712`
名称	SmilChr05G002712
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg01250-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31235920 - 31236411 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025798`
GeneID	`131025798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025798`
原始查询	`SmilChr05G002712`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=33.6; qcov=0.693; evalue=4.08e-12; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=36.2; qcov=0.982; evalue=2.49e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811570.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811570.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811570.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811570.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31235921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B56
`Chr5:31235929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B112,B65,B69,C16,C5,C82,D1
`Chr5:31235944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:31235950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B57
`Chr5:31235971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A1,A20,A4,A5,A7,B100,B101,B102,B104,B111,B122,B124,B126,B135,B138,B16,B20,B34,B36,B39,B44,B49,B52,B59,B61,B74,B75,B80,B84,B89,B90,B94,B99,C13,C14,C15,C19,C30,C34,C4,C40,C43,C44,C46,C48,C50,C52,C59,C60,C61,C63,C64,C67,C73,C79,C80,C87,D4,D7,D9
`Chr5:31236027`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A1,A3,A7,B108,B122,B125,B32,B84,B89,C14,C21,C30,C5,C79
`Chr5:31236029`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A1,A3,A7,B108,B122,B125,B32,B84,B89,C14,C21,C30,C5,C79
`Chr5:31236134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:31236235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B87,C30,C34,C72
`Chr5:31236237`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B129,B21,B87,C30,C34,C72
`Chr5:31236239`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B129,B21,B87,C30,C34,C72
`Chr5:31236257`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B109,B112,B38,B39,B65,B69,C16,C5,C75,C82,D1,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811570.1

163 aa

163

RVT_1

PF00078 RVT_1 3-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811570.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	3	137	1.5e-10	42.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955587.1
ATGGTCAATGGCAGCCCATCGGGAGAGTTTCAATTGAAAAGAGCTTTTAGACAAGGCGATCCCCTTTCTCCATTTCTGTTTCTAATTGTGGCGGAAGGGTTAAATTTGCTAGTCGAAAGAACAGTGCAAAAAGAGCTACTGGAACCGGTCAAAATTAGGAGAGAAGAGATTGAGGTCTTTCACTTACAATATGCGGATGACACAATGTTTGTGGCTTCGGATAAGAAGGAAAATGCCTGGGATTTTAAGAGCATCCTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025798
ATGGTCAATGGCAGCCCATCGGGAGAGTTTCAATTGAAAAGAGCTTTTAGACAAGGCGATCCCCTTTCTCCATTTCTGTTTCTAATTGTGGCGGAAGGGTTAAATTTGCTAGTCGAAAGAACAGTGCAAAAAGAGCTACTGGAACCGGTCAAAATTAGGAGAGAAGAGATTGAGGTCTTTCACTTACAATATGCGGATGACACAATGTTTGTGGCTTCGGATAAGAAGGAAAATGCCTGGGATTTTAAGAGCATCCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811570.1
MVNGSPSGEFQLKRAFRQGDPLSPFLFLIVAEGLNLLVERTVQKELLEPVKIRREEIEVFHLQYADDTMFVASDKKENAWDFKSILRLFELLSGLTVNFDKSNIMGVGIAEPKCDEMAEIMDCKVGEIPTKYLGIKIGMRLNWSMDWKYLVEKIKKKISGWNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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