当前解析结果
SmilChr05G002713| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002713 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002713 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002713 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 31249526 - 31250652 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025799 |
|---|---|
| GeneID | 131025799 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025799 |
| 原始查询 | SmilChr05G002713 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=41; qcov=0.382; evalue=4.21e-23; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025799 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811571.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057811571.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057811571.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057811571.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811571.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:31249547 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 19 | A10,A14,A22,A25,B136,B26,B28,B33,B79,C31,C4,C46,C5,C59,C64,C71,C74,D10,D8 |
Chr5:31249564 |
T |
TAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A19,B26,B60,C4,C46,C74 |
Chr5:31249565 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A19,B26,B60,C4,C46,C74 |
Chr5:31249578 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A14 |
Chr5:31249578 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr5:31249596 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A25 |
Chr5:31249660 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A25,B136 |
Chr5:31249665 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C83 |
Chr5:31249665 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr5:31249682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C75,C82 |
Chr5:31249812 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr5:31249826 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,C83,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。