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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002723`

染色体: Chr05 坐标: 31327760-31329105 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002723`
名称	SmilChr05G002723
描述	uncharacterized SmilChr05G002723
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31327760 - 31329105 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026456`
GeneID	`131026456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026456`
原始查询	`SmilChr05G002723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=64.1; qcov=0.915; evalue=1.09e-134; confidence=high
Rice	`Os01g0872900` - identity=45.8; qcov=0.493; evalue=3.55e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812312.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057812312.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057812312.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812312.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812312.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31327866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B71
`Chr5:31327880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B91
`Chr5:31327907`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B42,B9,B96,C48,C82,C86
`Chr5:31327923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B38
`Chr5:31327924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C24,C84
`Chr5:31327925`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119
`Chr5:31327925`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B119
`Chr5:31327932`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B9,B96,C48,C82,C86
`Chr5:31327932`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B9,B96,C48,C82,C86
`Chr5:31327935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:31327939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B91
`Chr5:31327943`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A18,A21,B3,B7,B88,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812312.1

341 aa

170

341

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 44-81 aa PF04827 Plant_tran 176-280 aa PF13359 DDE_Tnp_4 193-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812312.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	44	81	2.2e-18	66.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057812312.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	176	280	1.1e-56	192.4	Plant transposon protein
`XP_057812312.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	193	271	2.9e-06	27.7	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956329.1
TCATAATATTGGTTCTTCTTCACTACTTTCTCATTCAAGTTCAAGCTCATCTGATGATGAGCTTGAACAATTAATCAACGAGTGTGATGTTGAACATCAATTGATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTATTTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026456
ATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTATTTTTTTGAAAATCCAACATTCAACGAAGGAATGTTTCGTAGACGCTTTCGAATGTCTCGAAGTCTATTCCTCCGTATTGTTGATGCTGTCAAAAATCATAATGGTTTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812312.1
MGQHILNNNLIVAQLAEYQNATKIHGGSVLGHKVIHRDREAAAHRLFNDYFFENPTFNEGMFRRRFRMSRSLFLRIVDAVKNHNGFFEQRMDCTGRWGLSRPQKITAAFRILAYGVPADATDEYINISESTAIKCVKKFCRAIVEIFSDQYLRSPNASDVARLLYIGKQRGFPGIGITPPTHYVIQGKEYNVGYYLADGIYPKWSTLVQTFHEPRSVKKKFFAMRQESCRKDVERAFGVLQSRFVIVANPARYWQKKHLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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