当前解析结果
SmilChr05G002727| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002727 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002727 |
| 描述 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 31380289 - 31384080 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026462 |
|---|---|
| GeneID | 131026462 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026462 |
| 原始查询 | SmilChr05G002727 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| 产物 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| Arabidopsis | AT1G17080 (AT1G17080)Ribosomal protein L18ae family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838278] identity=57.2; qcov=1.07; evalue=1.51e-54; confidence=high |
| Rice | Os01g0667100- identity=57; qcov=1.01; evalue=2.63e-40; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026462 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057812321.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057812320.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057812320.1 |
| 4 | Membrane raft | 膜筏 | 0.20000 | XP_057812321.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057812321.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:31380743 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,C35 |
Chr5:31382129 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A23,B120,B128,B14,B17,B55,B56,B70,B79,B85,B96,C23,C27,C39,C53,C74,C81 |
Chr5:31382281 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A16,A22,A4,B105,B110,B120,B125,B135,B140,B18,B21,B24,B25,B44,B47,B56,B58,B6,B60,B63,B68,B8,B82,B85,B86,B91,B95,B96,C10,C12,C14,C15,C16,C18,C29,C35,C37,C38,C42,C48,C56,C63,C64,C65,C66,C70,C72,C8,C86,D1,D10,D2,D5 |
Chr5:31383827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,C35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。