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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002734`

染色体: Chr05 坐标: 31469562-31471075 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002734`
名称	SmilChr05G002734
描述	uncharacterized SmilChr05G002734
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31469562 - 31471075 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026468`
GeneID	`131026468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026468`
原始查询	`SmilChr05G002734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717339]; symbol=AT1G48720; hit=AT1G48720; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717339]; symbol=AT1G48720; hit=AT1G48720; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G48720` (AT1G48720) Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717339] identity=66.3; qcov=0.453; evalue=1.12e-41; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=29.3; qcov=0.975; evalue=2.03e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13961 (DUF4219); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057812328.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812328.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812328.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812328.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812328.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31470311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B58,B65
`Chr5:31470332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:31470349`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B43,C49
`Chr5:31470349`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B43,C49
`Chr5:31470356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B78,B94,C63
`Chr5:31470434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B126,B35,C27
`Chr5:31470457`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B102,C2,C64,D6
`Chr5:31470457`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B102,C2,C64,D6
`Chr5:31470465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C46,C50
`Chr5:31470494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B43
`Chr5:31470521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B108
`Chr5:31470536`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812328.1

203 aa

102

203

DUF4219

Retrotran_gag_2

PF13961 DUF4219 12-38 aa PF14223 Retrotran_gag_2 24-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812328.1`	Pfam	`PF13961`	DUF4219	Domain	12	38	1.6e-10	41.1	Domain of unknown function (DUF4219)
`XP_057812328.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	24	203	2.7e-34	119.1	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956345.1
AAGAAAAATTGTGTTAGTTAACAACAATCCTCCCACTCAAATTCCTAAGCACACACACGTCCACAACCAATTTCTCCAAATTTCCTCCTACCAATTAAATAAATTCTCCATTATATATTCTTATATTCCAACAAAGTGGTATCAGAGCCACAAGATTCTACTTGTGGTATGGCGAATTTACAATCGTTTCAAGTCCCCATGCTCAACAAAAGCAACTTCGACAATTGGAGCATCAAGATGAAGGCGCTATTGGGAGCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026468
ATGGCGAATTTACAATCGTTTCAAGTCCCCATGCTCAACAAAAGCAACTTCGACAATTGGAGCATCAAGATGAAGGCGCTATTGGGAGCCCACGACGTTTGGGAGATCGTGGAGAACGGCTACGAGGAGCCGCAGGACGAGGCCGCACTATCCCAACAACAAAAGGATAGATTGCGAGACATGAGAAAGAGAGACAAGAAGGCTCTCTGTCTCATTTATCAAGCGCTGGGGGACGACGATTTCGAGAAAATCTCGAACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812328.1
MANLQSFQVPMLNKSNFDNWSIKMKALLGAHDVWEIVENGYEEPQDEAALSQQQKDRLRDMRKRDKKALCLIYQALGDDDFEKISNASTAKEAWEKLQNACKGAEQVKKVRLQTLRGEFESLHMKESESISDYFSRVLAVSNQMKRNGEKLEDVRIMEKILRSLTPRFEHIVITIEETKNLEEMTIDLLLGSLQAYDEKQKKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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