当前解析结果
SmilChr05G002741| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002741 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002741 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002741 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 31579540 - 31582866 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025805 |
|---|---|
| GeneID | 131025805 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025805 |
| 原始查询 | SmilChr05G002741 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025805 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811577.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057811577.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057811577.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057811577.1 |
| 5 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057811577.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:31579539 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C21 |
Chr5:31579543 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 41 | B103,B104,B105,B111,B118,B128,B134,B136,B137,B16,B36,B39,B50,B58,B60,B65,B70,B73,B8,B81,B83,B97,C15,C16,C18,C25,C31,C36,C38,C49,C5,C50,C55,C56,C57,C59,C64,C66,D1,D6,D9 |
Chr5:31579616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,C56 |
Chr5:31579774 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B69,C38,C71 |
Chr5:31580192 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C29,C56,C67,C72,D2 |
Chr5:31580213 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A4,B78,B81 |
Chr5:31580289 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B38,B39,C13 |
Chr5:31580289 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B38,B39,C13 |
Chr5:31580363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr5:31580364 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr5:31580368 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr5:31580374 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 80 | A1,A11,A13,A14,A15,A19,A20,A24,A3,A4,A6,A8,A9,B105,B106,B11,B110,B111,B114,B121,B129,B133,B134,B137,B139,B18,B19,B22,B23,B25,B29,B33,B45,B52,B55,B57,B6,B60,B66,B73,B74,B75,B79,B81,B86,B87,B88,B9,B97,B99,C10,C26,C27,C28,C30,C31,C35,C36,C37,C39,C41,C48,C50,C51,C52,C54,C59,C7,C71,C75,C76,C77,C79,C82,C83,C84,D1,D11,D3,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。