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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002753`

染色体: Chr05 坐标: 31803026-31804781 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002753`
名称	SmilChr05G002753
描述	uncharacterized SmilChr05G002753
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31803026 - 31804781 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986841`
GeneID	`130986841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986841`
原始查询	`SmilChr05G002753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.7; qcov=0.754; evalue=1.23e-23; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.7; qcov=0.993; evalue=3.83e-52; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766350.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766350.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766350.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766350.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31803254`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B35,C83,C85
`Chr5:31803254`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B35,C83,C85
`Chr5:31803262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:31803299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:31803367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C87
`Chr5:31803387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B42,B43
`Chr5:31803402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B78
`Chr5:31803405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,C85
`Chr5:31803430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:31803603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B42,B43
`Chr5:31803810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C83
`Chr5:31803822`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766350.1

414 aa

207

414

SWIM

PF04434 SWIM 182-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766350.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	182	212	4e-10	39.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910367.1
TGAGTTATACAGAGAAGATCCTTTTTGTAAATTACAAGATGATATAGCTGAAGTTTATGATGAATTAGAGCATGTCAGTGCAAAGGGGAAAGGCAAACAGAATAAAATAAAATGATCAAATGTTCCCTATTTCATGGGCTGTTGTGGAGGTTGAGAACACTGAAAATTGGACCTGGTTCATAAAAATTCTCATGGAAGAGCTTGAGATGGATAATGGACTAGGAATTACCTTTATTTCGGACCAACAAAAGGTAGATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986841
ATGTTATTCATGCAGGGTCTTATTCATGCAGTTAGCACATTGGCACCACTAGCAGAGCATAGAAATTGTGCCCGACATGTATATGCTAATTGGAAGAAACAACACAAAGGTATAACACTGAAGAATATGTTCTGGAATGCAGTTAGAGCCACATATGTTGAACAATACAAGTTGGCAATTGAGGATATTAAAAGTGAGAAGCCTGCAGCGTATGAGGATTTCATTGAGCGAGGGCCACAAAAATTTTGTAAGGCTTTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766350.1
MLFMQGLIHAVSTLAPLAEHRNCARHVYANWKKQHKGITLKNMFWNAVRATYVEQYKLAIEDIKSEKPAAYEDFIERGPQKFCKAFLNTFPRCDMVDNNISETFNGYIINARGKHVIDMLEDIRCSLMERQYKKIVEIEALHDRLCPKVRKKLDKLKAQSRFCIPHPALGGFFEVDMFDDKFVVSVEGKTCTCRAWDLSGIPCVHAISAFYFLKQDPAEVVHDYFTIERYKKAYEFGIAPLNGEKLWPNAEGWVVKAPKC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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