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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002757`

染色体: Chr05 坐标: 31865341-31870591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002757`
名称	SmilChr05G002757
描述	ribokinase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31865341 - 31870591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986844`
GeneID	`130986844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986844`
原始查询	`SmilChr05G002757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribokinase
产物	ribokinase
Arabidopsis	`AT1G17160` (AT1G17160) pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838287] identity=71.8; qcov=0.92; evalue=7.18e-169; confidence=high
Rice	`Os01g0665400` - identity=72.2; qcov=0.845; evalue=1.83e-155; confidence=high
GO	GO:0004747 (ribokinase activity); GO:0006014 (D-ribose metabolic process)
KEGG	smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00294 (PfkB); PF08543 (Phos_pyr_kin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766359.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057766359.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766359.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766359.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31865509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B44,C35
`Chr5:31865737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B80
`Chr5:31868926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:31869672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B80,B93
`Chr5:31869731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766359.1

362 aa

181

362

PfkB

Phos_pyr_kin

PF00294 PfkB 56-350 aa PF08543 Phos_pyr_kin 227-333 aa

XP_057766360.1

362 aa

181

362

PfkB

Phos_pyr_kin

PF00294 PfkB 56-350 aa PF08543 Phos_pyr_kin 227-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766359.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	56	350	1.2e-61	209.4	pfkB family carbohydrate kinase
`XP_057766359.1`	Pfam	`PF08543`	Phos_pyr_kin	Family	227	333	2.7e-11	44.1	Phosphomethylpyrimidine kinase
`XP_057766360.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	56	350	1.2e-61	209.4	pfkB family carbohydrate kinase
`XP_057766360.1`	Pfam	`PF08543`	Phos_pyr_kin	Family	227	333	2.7e-11	44.1	Phosphomethylpyrimidine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910377.1
ATGAATAAAACAAAATCCTACATCAACCTTACTTCAGCTCGAGTCCAACAACACACACAGTCACAGAGGGATCAATCAGAAAATGGGAGCATTTGCGGCACTCTCGACACCAACTCCATGGGGCCAAGCCCAGTACCGCGAGAGCCCCACAATCCACAACCAATCCGCCCCCTCCGCCCATTTCCGTCCCCCACCCAGGCCCTTTTCGTGCTTCGCCTTGGACGCCTCCAGGGACAACGTGCCGCCGCTGGTGGTGGTGG...

XM_057910376.1
GAATAAAACAAAATCCTACATCAACCTTACTTCAGCTCGAGTCCAACAACACACACAGTCACAGAGGGATCAATCAGAAAATGGGAGCATTTGCGGCACTCTCGACACCAACTCCATGGGGCCAAGCCCAGTACCGCGAGAGCCCCACAATCCACAACCAATCCGCCCCCTCCGCCCATTTCCGTCCCCCACCCAGGCCCTTTTCGTGCTTCGCCTTGGACGCCTCCAGGGACAACGTGCCGCCGCTGGTGGTGGTGGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986844
ATGGGAGCATTTGCGGCACTCTCGACACCAACTCCATGGGGCCAAGCCCAGTACCGCGAGAGCCCCACAATCCACAACCAATCCGCCCCCTCCGCCCATTTCCGTCCCCCACCCAGGCCCTTTTCGTGCTTCGCCTTGGACGCCTCCAGGGACAACGTGCCGCCGCTGGTGGTGGTGGGCTCCGCCAACGCCGACATTTACGTGGAGATCGACCGCCTGCCCAAGGAGGGCGAGACCGTTTCCGCCAGAACCGGGCAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766359.1
MGAFAALSTPTPWGQAQYRESPTIHNQSAPSAHFRPPPRPFSCFALDASRDNVPPLVVVGSANADIYVEIDRLPKEGETVSARTGQTLAGGKGANQAVCGGKLAYPTYFVGQVGEDAHGRLITDALQGGGVLLDRLTTVAHFPTGHAVVMLQSDGQNSIIIVGGANMAGWPDILPPEDLDVVKNAGIVLLQREIPDQVNLQVAKAARSSGVPVILDAGGVDAPIPPELLKFISILSPNETELARLTNMSTESFEQISQAA...

XP_057766360.1
MGAFAALSTPTPWGQAQYRESPTIHNQSAPSAHFRPPPRPFSCFALDASRDNVPPLVVVGSANADIYVEIDRLPKEGETVSARTGQTLAGGKGANQAVCGGKLAYPTYFVGQVGEDAHGRLITDALQGGGVLLDRLTTVAHFPTGHAVVMLQSDGQNSIIIVGGANMAGWPDILPPEDLDVVKNAGIVLLQREIPDQVNLQVAKAARSSGVPVILDAGGVDAPIPPELLKFISILSPNETELARLTNMSTESFEQISQAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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