当前解析结果
SmilChr05G002762| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002762 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002762 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002762 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 31964572 - 31966382 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986849 |
|---|---|
| GeneID | 130986849 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986849 |
| 原始查询 | SmilChr05G002762 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820704]; symbol=AT3G14760; hit=AT3G14760; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820704]; symbol=AT3G14760; hit=AT3G14760; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G14760 (AT3G14760)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820704] identity=38; qcov=1; evalue=4.07e-24; confidence=medium |
| Rice | Os02g0321600- identity=49.1; qcov=0.322; evalue=3.26e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986849 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057766366.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057766366.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766366.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766366.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766366.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:31964887 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A1,A2,A24,A7,B10,B100,B12,B122,B14,B140,B17,B30,B36,B59,B63,B66,B70,B72,B76,B80,B82,B9,B90,B93,B97,C21,C54,C70,C78,C79,C84,C9,D11,D3,D8 |
Chr5:31965094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C22,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。