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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002771`

染色体: Chr05 坐标: 32232920-32233363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002771`
名称	SmilChr05G002771
描述	uncharacterized SmilChr05G002771
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32232920 - 32233363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025811`
GeneID	`131025811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025811`
原始查询	`SmilChr05G002771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0630250` - identity=32.8; qcov=0.789; evalue=4.78e-09; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811583.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811583.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811583.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811583.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32232928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr5:32232929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B107,B34
`Chr5:32232952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B107
`Chr5:32232969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A22,B126,B56,B62,B88,C44,C63,C67,C80,C81,D8
`Chr5:32232976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A1,A21,A23,A9,B104,B105,B119,B123,B129,B134,B16,B21,B33,B37,B41,B44,B66,B7,B71,B78,B87,C14,C18,C2,C3,C30,C32,C33,C42,C48,C56,C61,C67,C68,C82,D2,D6,D8
`Chr5:32232980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A22,B56,B62,B88,C44,C63,C67,C80,C81
`Chr5:32232981`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A22,B56,B62,B88,C44,C63,C67,C80,C81
`Chr5:32233000`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A1,A14,A21,A3,A6,B103,B107,B115,B128,B129,B137,B14,B16,B32,B72,B73,B75,B76,B78,B93,B98,C14,C17,C23,C27,C33,C38,C42,C44,C48,C50,C54,C55,C60,C63,C85
`Chr5:32233002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B37,B44
`Chr5:32233005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B135,B54,B78,C75
`Chr5:32233011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr5:32233017`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811583.1

147 aa

147

RVT_3

PF13456 RVT_3 8-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811583.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	8	114	4.7e-17	62.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955600.1
ATGGGTGCCCCGGGCATTATCGCTGCGGGCGGGGTGTTTAGAGATAATTGGGGCTGGGTTCGAGGTTGTTTCCACTTTAAAGGGGGCAAGGGTTTTGCTTTTGAGGCTGAACTCCTCGATGTTATTCATGCTATTGACATAGCTCACCATCGTGGCTGGCGGCAACTCTGGCTTGAAGCTGATTCGACTTATATTGTTCGTCTTCTTCAGACTCGATCGGTTGAAGTGCCTTGGCGCTTTCTGGCGGCTTGGAAAAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025811
ATGGGTGCCCCGGGCATTATCGCTGCGGGCGGGGTGTTTAGAGATAATTGGGGCTGGGTTCGAGGTTGTTTCCACTTTAAAGGGGGCAAGGGTTTTGCTTTTGAGGCTGAACTCCTCGATGTTATTCATGCTATTGACATAGCTCACCATCGTGGCTGGCGGCAACTCTGGCTTGAAGCTGATTCGACTTATATTGTTCGTCTTCTTCAGACTCGATCGGTTGAAGTGCCTTGGCGCTTTCTGGCGGCTTGGAAAAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811583.1
MGAPGIIAAGGVFRDNWGWVRGCFHFKGGKGFAFEAELLDVIHAIDIAHHRGWRQLWLEADSTYIVRLLQTRSVEVPWRFLAAWKKSLRLLDDFQFQVSHIYREGNKPADLMANLDRNEGWWPYALDEIKLAVSLDMATHSTVHVKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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