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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002775`

染色体: Chr05 坐标: 32294933-32312781 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002775`
名称	SmilChr05G002775
描述	protein trichome birefringence-like 41
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32294933 - 32312781 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986862`
GeneID	`130986862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986862`
原始查询	`SmilChr05G002775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 41
产物	protein trichome birefringence-like 41
Arabidopsis	`AT3G14850` (TBL41) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 41 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820714] identity=58.8; qcov=0.937; evalue=3.02e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0652100` (OsTBL21) - identity=53.5; qcov=0.929; evalue=3.09e-129; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057766376.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057766376.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057766376.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057766376.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32295091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B53,C33,C78
`Chr5:32295155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:32295164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B75,B9
`Chr5:32295165`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr5:32295165`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr5:32295182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr5:32295200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:32295214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B65,C16,D1
`Chr5:32295302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B17,B80,C83
`Chr5:32295314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B122,C42,D8
`Chr5:32295355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C84
`Chr5:32295780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B4,B65,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766376.1

350 aa

175

350

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 27-82 aa PF13839 PC-Esterase 83-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766376.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	27	82	4.9e-23	81.9	PMR5 N terminal Domain
`XP_057766376.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	83	347	3.2e-88	297.1	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910393.1
TACTAATTCTTCACCCCATACAAAAGCACACATATTGAGAAAGACAGACATATATACCCAGATAGGTGAGGTATCGTCTTTTCTCTCTTTCTCTCCCTTAGCCGTGTTGCTGCTTCCAATAACTTGTGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAGGTTAAGGGCTGTAGTGGTTGCAACTGCCGTTAGCTGGTTAGTGTTGCTGCAATCCAAGTCAAATGCAGAGCAAAAATCATGTGATCTATTTGAAGGGAAGTGGGTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986862
ATGAGGTTAAGGGCTGTAGTGGTTGCAACTGCCGTTAGCTGGTTAGTGTTGCTGCAATCCAAGTCAAATGCAGAGCAAAAATCATGTGATCTATTTGAAGGGAAGTGGGTGTTTAATTCGTCTTCATCGTATCCTCTCTACAACTACACATCATGCCCCTTCATTCAGAAGGAGTTCAACTGCCACAACAATGGCCGCTCCGACGACTTGTACCTTAAGTACAACTGGCAGCCCCACTCCTGCAGCTTATCAAGATTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766376.1
MRLRAVVVATAVSWLVLLQSKSNAEQKSCDLFEGKWVFNSSSSYPLYNYTSCPFIQKEFNCHNNGRSDDLYLKYNWQPHSCSLSRFDGENLLKTYKGKSIMFVGDSLSRNQWESLICMLIAAVPEINYTHTSSAELTIFTFTDYEVKVMLDRSVYLVDLVGEAQGRILKLDSIQGGKRWLGVDTLIFNTWHWWNRRGASQPWDYIEVDGQLYKDMDRVVAFEKALNTWATWVDENIDPTSIMPNVFFQGISPSHYNGSEW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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