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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002786`

染色体: Chr05 坐标: 32559039-32568055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002786`
名称	SmilChr05G002786
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32559039 - 32568055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986872`
GeneID	`130986872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986872`
原始查询	`SmilChr05G002786`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440
Arabidopsis	`AT1G53440` (AT1G53440) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841779] identity=62.3; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0203400` (SHR5) - identity=44.1; qcov=0.942; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766382.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766382.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766382.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766382.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32559921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B27,B99,C4,C75
`Chr5:32560903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:32560913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:32561242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:32563997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:32564018`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B20,B93,C53,C85
`Chr5:32564018`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B20,B93,C53,C85
`Chr5:32564553`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B20,C53
`Chr5:32564553`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B20,C53
`Chr5:32565031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B23,B65
`Chr5:32565264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A19,A9,B113,B29,B73,C1,C2,C27,C43,C58,C86,D5
`Chr5:32565419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766382.1

999 aa

500

999

LRR_1

LRR_8

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 109-130 aa PF00560 LRR_1 179-201 aa PF13855 LRR_8 275-334 aa PF11721 Malectin 402-582 aa PF00069 Pkinase 658-924 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 659-927 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	109	130	2.8e-22	74.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	179	201	2.8e-22	74.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	275	334	1.2e-17	64.1	Leucine rich repeat
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	402	582	2.9e-36	125.7	Malectin domain
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	658	924	8.1e-46	157.3	Protein kinase domain
`XP_057766382.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	659	927	3.9e-48	164.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910399.1
TGAGTTATAGCTTTAAAGTTTAAACTGATTTGCGCAAATCTAAAGTTGGCTTGACTTTTCGATTTGATGCATGTTTTGTCTTTTGCTTTTCTTTGTCACCTTGTTTTTGGACAATGGAAAATTGTGTCGCCAAAATCCTTCTTGCAACTGCGTTTGCAACCTTACTTCTGATATCCGACGCGCAACTTCTGCCCGAAAATGAAGTTGAAGCTCTTCAAATAATATCCTCAAAGCTACACAACACTTATTGGGACTATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986872
ATGGAAAATTGTGTCGCCAAAATCCTTCTTGCAACTGCGTTTGCAACCTTACTTCTGATATCCGACGCGCAACTTCTGCCCGAAAATGAAGTTGAAGCTCTTCAAATAATATCCTCAAAGCTACACAACACTTATTGGGACTATATTAATGGAAGCTCTTGCTATGGTGGATTTAACTTCAATGAAGGGGTTAAGAATGTATACAGCAGTTTAGTGTGCGACTGTACCTTTAATAGTAGCACCGTATGCCATGTAACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766382.1
MENCVAKILLATAFATLLLISDAQLLPENEVEALQIISSKLHNTYWDYINGSSCYGGFNFNEGVKNVYSSLVCDCTFNSSTVCHVTHMQLRGLNLTGTLPEEFVNLTYLQELDLTLNYLSGSIPTIFGQLRLIKLSLLGNHISGKIPAEIGNITTLEDLVLDDNLLEGNLPENLGSLSNLKRLLLSANNFSGNIPATFGNLRNLRDFRIDGSRMSGKIPDFIGNWAQLTRLDMQGTSMEGPIPAAISRLKHLTDLRISDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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