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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002792`

染色体: Chr05 坐标: 32646212-32647207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002792`
名称	SmilChr05G002792
描述	uncharacterized SmilChr05G002792
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32646212 - 32647207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986880`
GeneID	`130986880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986880`
原始查询	`SmilChr05G002792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G53400` (AT1G53400) Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776] identity=76.4; qcov=0.965; evalue=9.06e-63; confidence=high
Rice	`Os09g0345000` - identity=69.8; qcov=1.02; evalue=3e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16455 (UBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766398.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766400.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057766400.1`
4	Growth cone	Growth cone	0.20000	`XP_057766400.1`
5	Pseudopodium	Pseudopodium	0.20000	`XP_057766400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32646613`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	B105,B109,B112,B113,B115,B117,B118,B13,B24,B31,B48,B83,B9,B90,B92,C3,C59,C64,C66,C79,C9
`Chr5:32646632`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A16,A20,A4,A8,B118,B12,B131,B19,B37,B39,B41,B46,B51,B58,B67,B74,B77,B79,B84,C10,C15,C25,C26,C45,C61,C74,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766398.1

128 aa

128

UBD

PF16455 UBD 16-101 aa

XP_057766400.1

114 aa

114

UBD

PF16455 UBD 16-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766398.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	16	101	3.1e-25	89.0	Ubiquitin-binding domain
`XP_057766400.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	16	113	4.4e-34	117.5	Ubiquitin-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910417.1
TAGATGGATCATCGCCAACCAAACAAAATAGCGACAGGTACACCGTCTCTCTTCGTCAGTCGAGACGAAAATACTCTGTTTTCATCTGCAGGTTGCCAAGAATGGGATGTGCTGGATCCTCGCAGACAAAAGCAGAAGGCAGTGTTAAACAGATAAAGAAACCGAGATCGTGGAAGCATCCACAGCCCATCACCATAAGTCAGCTGATACAGCTGAGAGAAGAGTTTTGGGATACTGCTCCTCACTATGGTGGTAGGAAA...

XM_057910415.1
TAGATGGATCATCGCCAACCAAACAAAATAGCGACAGGTACACCGTCTCTCTTCGTCAGTCGAGACGAAAATACTCTGTTTTCATCTGCAGGTTGCCAAGAATGGGATGTGCTGGATCCTCGCAGACAAAAGCAGAAGGCAGTGTTAAACAGATAAAGAAACCGAGATCGTGGAAGCATCCACAGCCCATCACCATAAGTCAGCTGATACAGCTGAGAGAAGAGTTTTGGGATACTGCTCCTCACTATGGTGGTAGGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986880
ATGGGATGTGCTGGATCCTCGCAGACAAAAGCAGAAGGCAGTGTTAAACAGATAAAGAAACCGAGATCGTGGAAGCATCCACAGCCCATCACCATAAGTCAGCTGATACAGCTGAGAGAAGAGTTTTGGGATACTGCTCCTCACTATGGTGGTAGGAAAGAAATCTGGGATGCACTCAGAGCAGCAGCGGAAGCTGATCCAAAGCTTGCTCAGGCAATCGTGGAGAGTGCCGGAATCATACTACAAAATCCTGATATGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766398.1
MGCAGSSQTKAEGSVKQIKKPRSWKHPQPITISQLIQLREEFWDTAPHYGGRKEIWDALRAAAEADPKLAQAIVESAGIILQNPDMTVCFDEGGNITYFLFVCVSFSILPLFELAMLQVQDMNYLRMF

XP_057766400.1
MGCAGSSQTKAEGSVKQIKKPRSWKHPQPITISQLIQLREEFWDTAPHYGGRKEIWDALRAAAEADPKLAQAIVESAGIILQNPDMTVCFDEGGARYELPTYVLSEPKNLIRDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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